魚類自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗證.pdf

1、分類號j：UDC——IIIIIIIIIIIIIIIIIIII、Y3275109學(xué)號叢!!!!!密級——埸H大譬YANGZHOUUNIVERSlTY碩士學(xué)位論文(全日制學(xué)術(shù)學(xué)位)魚類自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗證鐘繼漢申請學(xué)位級別：碩士論文提交日期：2Q12生壘旦論文答辯日期：2Q!Z生三旦2Z旦學(xué)位授予單位：塹劌盤鱟學(xué)位授予13期：2Q12生魚旦2Q旦2017年5月魚類自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗證魚類自主pogo轉(zhuǎn)

2、座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗證中文摘要Tcl轉(zhuǎn)座子超家族廣泛分布于細(xì)菌、真菌及昆蟲等各種生物中，有些Tcl轉(zhuǎn)座子超家族成員已經(jīng)被開發(fā)為重要的遺傳育種操作工具，如SB轉(zhuǎn)座子已經(jīng)作為基因治療和轉(zhuǎn)基因的介導(dǎo)載體得到廣泛應(yīng)用。pogo轉(zhuǎn)座子是Tel轉(zhuǎn)座子超家族的重要成員，但對其分布、進(jìn)化和活性研究報道很少。本研究通過硬骨魚轉(zhuǎn)座組注釋，并在脊椎動物中針對Tcl轉(zhuǎn)座子超家族的重要成員pogo轉(zhuǎn)座子進(jìn)行分布、進(jìn)化和活性研究，以挖掘活性pogo轉(zhuǎn)座子，研發(fā)

3、自主知識產(chǎn)權(quán)的遺傳操作工具，為動物轉(zhuǎn)基因和基因治療等研究提供技術(shù)支撐。主要研究內(nèi)容如下：(1)通過生物信息學(xué)手段對9種硬骨魚轉(zhuǎn)座組進(jìn)行注釋。結(jié)果表明9種硬骨魚類轉(zhuǎn)座組大4；FD構(gòu)成差異顯著，其轉(zhuǎn)座組含量從高到低分別為斑馬魚、矛尾魚、青鯔魚、花斑劍尾魚、大西洋鱈魚、三刺魚、金娃娃、羅非魚和紅鰭東方純，轉(zhuǎn)座子含量和基因組大小呈正相關(guān)。DNA轉(zhuǎn)座子在硬骨魚類中具有多樣性高和含量差異大的特點(050％一3837％)，是硬骨魚類轉(zhuǎn)座組差異的主要決

4、定因素，其中hAT和Tc／Mariner超家族是硬骨魚類主要的DNA轉(zhuǎn)座子。RNA轉(zhuǎn)座子在硬骨魚類中也具有多樣性高的特點，其中LINE轉(zhuǎn)座子占硬骨魚類基因組053％566％，共檢測到12個(I、CRl、L1、L2、R1、R2、Jockey、RTE和Rex)超家族分布，其中L1、L2、RTE和Rex轉(zhuǎn)座子擴增較為明顯，LTR轉(zhuǎn)座子除了在斑馬魚和三刺魚中含量達(dá)到558％和251％，在大多硬骨魚類基因組中的含量低于2％，在硬骨魚類中共檢測到6