魚類自主pogo轉座子的挖掘、進化及活性驗證.pdf

1、分類號j：UDC——IIIIIIIIIIIIIIIIIIII、Y3275109學號叢!!!!!密級——埸H大譬YANGZHOUUNIVERSlTY碩士學位論文(全日制學術學位)魚類自主pogo轉座子的挖掘、進化及活性驗證鐘繼漢申請學位級別：碩士論文提交日期：2Q12生壘旦論文答辯日期：2Q!Z生三旦2Z旦學位授予單位：塹劌盤鱟學位授予13期：2Q12生魚旦2Q旦2017年5月魚類自主pogo轉座子的挖掘、進化及活性驗證魚類自主pogo轉

2、座子的挖掘、進化及活性驗證中文摘要Tcl轉座子超家族廣泛分布于細菌、真菌及昆蟲等各種生物中，有些Tcl轉座子超家族成員已經被開發(fā)為重要的遺傳育種操作工具，如SB轉座子已經作為基因治療和轉基因的介導載體得到廣泛應用。pogo轉座子是Tel轉座子超家族的重要成員，但對其分布、進化和活性研究報道很少。本研究通過硬骨魚轉座組注釋，并在脊椎動物中針對Tcl轉座子超家族的重要成員pogo轉座子進行分布、進化和活性研究，以挖掘活性pogo轉座子，研發(fā)

3、自主知識產權的遺傳操作工具，為動物轉基因和基因治療等研究提供技術支撐。主要研究內容如下：(1)通過生物信息學手段對9種硬骨魚轉座組進行注釋。結果表明9種硬骨魚類轉座組大4；FD構成差異顯著，其轉座組含量從高到低分別為斑馬魚、矛尾魚、青鯔魚、花斑劍尾魚、大西洋鱈魚、三刺魚、金娃娃、羅非魚和紅鰭東方純，轉座子含量和基因組大小呈正相關。DNA轉座子在硬骨魚類中具有多樣性高和含量差異大的特點(050％一3837％)，是硬骨魚類轉座組差異的主要決

4、定因素，其中hAT和Tc／Mariner超家族是硬骨魚類主要的DNA轉座子。RNA轉座子在硬骨魚類中也具有多樣性高的特點，其中LINE轉座子占硬骨魚類基因組053％566％，共檢測到12個(I、CRl、L1、L2、R1、R2、Jockey、RTE和Rex)超家族分布，其中L1、L2、RTE和Rex轉座子擴增較為明顯，LTR轉座子除了在斑馬魚和三刺魚中含量達到558％和251％，在大多硬骨魚類基因組中的含量低于2％，在硬骨魚類中共檢測到6