3株放線菌的分離鑒定及其遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的構(gòu)建與優(yōu)化.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、土壤微生物鏈霉菌是天然抗生素的重要來源,通過對土壤微生物鏈霉菌進行了分離、鑒定、遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的構(gòu)建及轉(zhuǎn)錄因子的功能研究,有助于挖掘其獨特的微生物資源和生物合成潛能,為重要基因簇功能的研究和開發(fā)在醫(yī)藥和農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域迫切需要的藥物奠定基礎(chǔ)。
  本研究以內(nèi)蒙古赤峰寧城縣青山林場土樣為材料,共分離得到63株鹽堿地放線菌。分別對這63株菌進行生物活性檢測,共獲得7株抑菌效果較好的菌株。然后對這7株放線菌進行遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的構(gòu)建,其中3株放線菌

2、的遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)構(gòu)建成功。
  對構(gòu)建好遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的3株放線菌S-5、S-27和S-28進行菌種鑒定,包括形態(tài)觀察、培養(yǎng)特征、生理生化及16S rDNA鑒定,最后初步鑒定這3株鏈霉菌S-5、S-27和S-28分別為Streptomyces alogtiseolus、treptomyces albus和streptomyces bacillari。
  通過接合轉(zhuǎn)移的方式對3株鏈霉菌S-5、S-27和S-28進行遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的

3、構(gòu)建,且3株鏈霉菌遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)均構(gòu)建成功。對其中一株鏈霉菌S-28的接合轉(zhuǎn)移系統(tǒng)進行優(yōu)化,包括:培養(yǎng)基的選擇、抗生素濃度、MgCl2的濃度、S-28孢子熱激條件、預(yù)萌發(fā)時間、供受體比例和接合時間等條件,最后確定了S-28菌株接合轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的最優(yōu)條件。
  經(jīng)基因組草圖測序分析,S-28菌株全基因組全長大約7,864,237bp,共獲得91個scaffolds,93個contigs,GC含量為71.95%。軟件預(yù)測CDs有6,882個

4、,通過多種數(shù)據(jù)庫對所得基因進行功能分類與注釋,以及antiSMASH在線分析,共有38個基因簇,表明該菌株含有較為豐富的次級代謝產(chǎn)物資源,有較高的開發(fā)利用價值。
  采用基因置換和框內(nèi)缺失技術(shù),對bldA基因和Ectione基因簇的MarR轉(zhuǎn)錄因子進行基因敲除,并對MarR轉(zhuǎn)錄因子進行異源表達。結(jié)果:成功表達了MarR轉(zhuǎn)錄因子蛋白。利用接合轉(zhuǎn)移的方法,將敲除載體pKC1132-L+Kan+R導(dǎo)入到S-28中,經(jīng)抗性篩選及PCR驗證

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