菠菜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及性別決定基因X-Y的精細定位.pdf

1、菠菜（Spinacia oleracea L.），黎科菠菜屬二倍體植株(2n=12)，是以綠葉為主要產(chǎn)品的重要蔬菜作物。菠菜是典型的雌雄異株植物，少量植株表現(xiàn)為兩性株，其雌雄性別受X/Y基因的控制，是研究雌雄異株植物性別決定及分化機制的一種理想材料。目前國內(nèi)外已構(gòu)建的菠菜遺傳圖譜分子標(biāo)記數(shù)量較少且不便于使用，缺乏高密度遺傳圖譜，且菠菜性別決定基因尚未精細定位及克隆，性別調(diào)控機制仍不明確。因此，本研究利用特異位點擴增片段測序(SLAF-s

2、eq)技術(shù)結(jié)合HighMap軟件構(gòu)建了菠菜高密度遺傳圖，并通過SRAP-BSA及super-BSA對菠菜性別決定基因XY進行了精細定位，借助基因注釋獲得了一些菠菜激素調(diào)控和開花相關(guān)的候選基因。主要研究結(jié)果匯總?cè)缦?
　　1、利用SLAF-seq技術(shù)結(jié)合HighMap構(gòu)建了菠菜高密度遺傳圖。該圖譜包含4080個SLAF標(biāo)記，共劃分為6個連鎖群，總圖距為1，125.97cM，相鄰標(biāo)記間的平均圖距為0.31cM，這是目前研究中密度最高的

3、菠菜遺傳圖譜。
　　2、利用SRAP-BSA法對菠菜性別決定基因X/Y進行初步定位，通過雌雄基因池對1280個SRAP引物組合進行篩選，其中20個引物組合與性別基因緊密連鎖。結(jié)合前人研究相關(guān)標(biāo)記，利用含148個單株的BC1群體構(gòu)建了一個15.9cM的菠菜性別區(qū)域連鎖圖，平均圖距為0.72 cM，將性別決定基因定位在一個0.4 cM的區(qū)間內(nèi)。
　　3、利用super-BSA法對性別決定基因X/Y進行精細定位。通過50個雌性單株

4、和50個雄性單株測序數(shù)據(jù)混池尋找菠菜性剮性狀關(guān)聯(lián)區(qū)域。最終有323個SLAF標(biāo)記與菠菜性別決定基因緊密連鎖，結(jié)合菠菜高密度遺傳圖譜，將菠菜性別決定區(qū)域定位在LG4連鎖群66.98cM-69.72cM和75.48cM-92.96cM兩個區(qū)間內(nèi)。
　　4、整合SLAF及SRAP等性別連鎖標(biāo)記，構(gòu)建了一個16.7cM的性別區(qū)域連鎖遺傳圖，將菠菜性別決定基因X/Y定位在0.2cM區(qū)間內(nèi)。通過性別區(qū)域連鎖遺傳圖，輔助菠菜基因組組裝，將sca