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文檔簡介
1、隨著我國人民生活水平的提高和社會老齡化,冠心病(coronaryheartdisease,CHD)的發(fā)病率和死亡率呈上升趨勢。如何降低CHD的發(fā)病率和死亡率成為公共衛(wèi)生和臨床醫(yī)學必須解決的一個重大問題。CHD是一種多基因、多步驟的疾病。各種研究表明,熱休克蛋白60(heatshcokprotein60,HSP60)抗原和抗體通過炎癥及免疫反應在CHD的發(fā)生和發(fā)展過程中起非常重要的作用。 Hsp60是一種線粒體分子伴侶,在應激條件
2、下表現(xiàn)出誘導性合成,保護細胞免受各種應激的損傷。很多已知的CHD危險因素(氧化的低密度脂蛋白、高血壓、感染、氧化損傷等)可刺激血管內皮細胞、平滑肌細胞表達Hsp60,由于人和微生物Hsp60在氨基酸序列上有50-70%的同源性,針對于微生物Hsp60的免疫反應可能和自身的Hsp60抗原發(fā)生交叉反應,導致血管內皮的損傷。 Hsp60表達量或表達亞型上的變化,可以改變Hsp60的抗原性及機體對應激因素的耐受性,進而影響個體對CHD的
3、易感性。目前的研究表明編碼區(qū)及調控區(qū)的單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)可能改變蛋白質表達的量或亞型,但很少有人研究hsp60SNPs意義及其在CHD發(fā)生和發(fā)展過程中的作用。 不同人種SNPs類型和頻率不同,美國國立生物技術信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)和歐洲生物信息學研究所(EuropeanBioinf
4、ormaticsInstitute,EBI)等公共數(shù)據(jù)庫收錄了60多個hsp60SNPs,其中6個為導致氨基酸改變的錯義SNPs,但這些SNPs缺乏頻率和人種信息。在中國漢族人群中進行hsp60SNPs與CHD關聯(lián)研究必須首先明確hsp60SNPs在中國漢族人群中的種類、頻率和分布規(guī)律。 對中國漢族人群hsp60再測序,是解決上述問題的最佳方法。因此本研究通過hsp60再測序,找出中國漢族人中常見的SNPs,并從中選擇有代表性的
5、SNPs,采用病例對照研究分析hsp60基因多態(tài)性與冠心病的關系。 第一部分hsp60基因多態(tài)性在中國漢族人群中的分布 本部分應用分片段擴增直接測序結合Taqman基因分型技術,檢測30名健康志愿者的hsp60基因5'側翼區(qū)、全部編碼區(qū)、內含子外顯子交界區(qū)序列,比較檢測結果和NCBI和EBI數(shù)據(jù)庫中的相應數(shù)據(jù),確定中國漢族人群hsp60基因SNPs的位置、類型和頻率。 結果顯示:1、研究人群中頻率大于1%的hsp
6、60SNPs共13個,其中4個為新發(fā)現(xiàn)SNPs。4個新SNPs分別是:位于2號染色體198189061的a/g(外顯子2),198184890a/g(外顯子5),198184774ag/--(內含子5),198180643ac/--(內含子7),雜合度分別為0.06、0.04、0.5、0.5;9個已報道的SNPs分別為rs1116734g/c,rs3749095c/t,rs1050347t/c,rs8539a/g,rs2340690t/
7、c,rs3214832tttgagttatcttatgatcaaaag/-,rs7585486c/g,198180659a/c(無rs編號),rs788016c/t;2、Rs1116734、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs788016在不同人種中的分布均有顯著性差異(P=0.00)。3、連鎖不平衡分析后發(fā)現(xiàn)rs1116734與198189061a/g,rs1116734與rs788016不存在連鎖不平衡。rs1
8、050347、rs2340690、rs3214832、rs7585486及198180659a/c(無rs編號)兩兩間完全連鎖不平衡,rs8539,198184774ag/--、198180643ac/-兩兩間完全連鎖不平衡。其余位點間均為中度連鎖不平衡。4、以r2大小(r2=1)及最小等位基因頻率(≥5%)對13個SNPs進行選擇,5個代表性SNPs位點rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690、rs78
9、8016可構成9種單倍型。 本部分結果表明中國漢族人群hsp60的SNPs分布有別于其他人種,rs1116734、rs3749095、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs3214832、198184774ag/--、rs7585486、198180659a/c、198180643ac/--、rs788016是hsp60基因在中國漢族人群中較常見的SNPs。rs1116734、rs3749095、rs8539
10、、rs2340690、rs788016是五個較有代表性的SNPs。 第二部分hsp60基因多態(tài)性在冠心病中的作用 根據(jù)位點間D值和SNPs頻率,從rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690、rs788016中優(yōu)先選擇rs788016和rs2340690,應用Taqman基因分型法在674名冠心病病例和744名對照中進行hsp60SNPs基因型與冠心病危險度關系的研究。 結果顯示:rs
11、788016和rs2340690各基因型在冠心病組和對照組的分布無顯著性差異(P>0.05);按性別、年齡、吸煙狀況進行分層后,在年齡小于60歲的男性冠心病患者中,hsp60基因rs788016GG基因型和rs2340690CC+CT基因型的頻率低于對照;rs788016AA+AG(相對于GG,OR:1.78,95%CI1.04-3.03)為該人群中冠心病發(fā)病的危險因素、rs2340690CC+CT(相對于TT,OR:0.58,95%C
12、I,0.62-5.20)為該人群中冠心病發(fā)病的保護因素,但分層分析表明基因型和冠心病發(fā)病無關。進一步采用Logistic回歸模型排除其他混雜因素分析男性吸煙組中rs788016基因型與冠心病的關系,調整其他因素后,rs788016AA+AG基因型(相對于GG基因型)對CHD有較高的危險性:OR:1.74,95%CI:1.08-2.82。 本部分結果提示在男性吸煙人群中,rs788016AA+AG基因型是冠心病發(fā)病的獨立危險因素。
13、 本研究的創(chuàng)新之處在于:(1)對中國漢族人群hsp60基因進行了再測序,發(fā)現(xiàn)了4個新SNPs;(2)揭示了中國漢族人群hsp60SNPs間的連鎖關系,找出了hsp60基因有代表性的SNPs,推算出hsp60基因在中國漢族人群的中主要單倍型;(3)首次進行了hsp60基因SNPs與冠心病關聯(lián)的研究,發(fā)現(xiàn)hsp60基因rs788016可能與冠心病發(fā)病生相關,攜帶rs788016GG基因型個體對冠心病易感性顯著降低。 本研究有
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