受磷蛋白的空間結構及其分子動力學模擬.pdf

1、肌漿網(wǎng)鈣泵是將鈣離子從細胞質內轉運到肌漿網(wǎng)內的重要跨膜蛋白，它的活性受到與之相互作用的受磷蛋白的調控。受磷蛋白存在磷酸化和非磷酸化兩種可逆狀態(tài)，非磷酸化時會抑制鈣泵的活性，磷酸化時會減小這種抑制作用。受磷蛋白的在生物體中的空間結構一直是一個受關注的焦點。本文通過總結受磷蛋白空間結構的研究進展，利用分子動力學模擬的方法，對其空間結構進行了系統(tǒng)的模擬和研究。 我們將核磁共振所得到的風鈴草結構單鏈的前22個殘基取出，并且分別保持原始結

2、構，而對第16位和第17位分別進行磷酸化，第9位進行單點突變，得到四個不同的肽段，然后使用AMBER模擬軟件將肽段分別置于不同的溶劑和離子濃度條件下，得到八個不同的模擬體系。分別依次進行能量最小化、升溫、平衡，和10納秒的模擬過程。另外還對單鏈和五聚體在水環(huán)境中進行了10納秒的模擬。 分析軌跡發(fā)現(xiàn)：原始結構的肽段可以很好的保持螺旋結構；兩個位點的磷酸化均會使肽段的結構區(qū)域無序化；第9位的單點突變會在此處形成一個彎折；在高離子濃度