玉米灰斑病抗性的QTL元分析和混池測(cè)序分析.pdf

1、玉米灰斑病由玉蜀黍尾孢菌（Cercosporazeae-maydis Tehon& Daniels）真菌病原引起，是全世界范圍內(nèi)最為嚴(yán)重的玉米葉片病害之一。自20世紀(jì)90年代以來(lái)，玉米灰斑病在我國(guó)逐漸加重，尤其是在我國(guó)東北和西南玉米產(chǎn)區(qū)日益成為一種重要的葉部病害。開(kāi)展玉米灰斑病的抗性遺傳和育種的研究，具有極其重要的理論意義和實(shí)踐價(jià)值。本文主要從玉米灰斑病抗性的QTL元分析和混池測(cè)序分析兩個(gè)方面，對(duì)玉米灰斑病進(jìn)行了初步的研究。主要結(jié)果如下

2、:
　　1.借助IBM22008 Neighbors圖譜，采用元分析方法整合優(yōu)化了65個(gè)已定位的抗玉米灰斑病QTL，獲得11個(gè)“一致性”QTL區(qū)間，分別位于染色體bin區(qū)的1.05、1.06、2.03、2.07、3.02、4.05、5.03、5.05、7.02、8.07、9.03位置，其在遺傳連鎖圖譜上對(duì)應(yīng)的位置分別為442.21、528.27、228.10、478.00、74.65、311.59、169.62、302.35、25

3、2.19、422.70、257.93 cM。對(duì)兩個(gè)報(bào)道較多和表型貢獻(xiàn)較高的“一致性”QTL區(qū)間bin1.05和bin1.06，從MaizeGDB網(wǎng)站搜索到324個(gè)基因。因抗病基因在結(jié)構(gòu)上具有高度保守性，將324個(gè)基因分別與水稻和擬南芥基因組進(jìn)行同源比對(duì)。在染色體bin1.05和bin1.06內(nèi)分別確定了7個(gè)和3個(gè)基因作為玉米抗灰斑病候選基因。
　　2.運(yùn)用Suwan1與待改良自交系HM04構(gòu)建的F2群體和Suwan1與待改良自交系

4、HM01回交構(gòu)建的BC1F1群體（各群體大小約為500），每個(gè)群體選取25-30個(gè)極端抗感植株，構(gòu)建了5個(gè)玉米灰斑病抗感混合池，其中F2群體包括2個(gè)抗病池（混池1和混池2），1個(gè)感病池（混池3），BC1F1群體包括抗感池各1個(gè)（混池4和混池5）。混池測(cè)序分析結(jié)果表明，F(xiàn)2群體抗感混池1 vs3和2 vs3間比對(duì)的差異位點(diǎn)數(shù)分別為26和22，BC1F1群體抗感混池間比對(duì)的差異位點(diǎn)數(shù)為32。F2群體和BC1F1群體抗感池間共有的差異位點(diǎn)數(shù)為