四氯化碳誘導(dǎo)小鼠肝臟組織纖維化的蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf

1、從世界范圍來看,飲酒、肝炎病毒感染和非酒精性脂肪性肝炎是促使肝組織慢性損傷發(fā)展形成纖維化、肝硬化和肝癌的三大主要原因。早在20世紀70年代,就有研究顯示肝臟組織纖維形成是一個可逆化的過程,Schaffner等也證明肝纖維化是慢性肝損傷發(fā)展進程中最后一個可逆化病理應(yīng)答階段。
　　本研究的目的是,腹腔皮下注射四氯化碳(CCl4,Carbon tetrachloride)誘導(dǎo)小鼠(C57 BL/6)肝組織纖維化的形成,同時,對照組注射橄

2、欖油(溶劑),誘導(dǎo)期限為15周;首先對兩組小鼠肝臟組織的全蛋白表達譜進行質(zhì)譜鑒定,發(fā)現(xiàn)并探討纖維化肝組織與正常肝組織在蛋白質(zhì)組水平上的差異,包括差異蛋白表達譜的分析以及差異蛋白的功能和信號通路富集分析。
　　方法:實驗小鼠隨機分為兩組,由橄欖油和四氯化碳誘導(dǎo)15周,并分別對這兩組肝組織的全蛋白表達譜進行質(zhì)譜檢測,本研究應(yīng)用基于肽段峰面積強度的定量方法(Intensity based absolute quantification,

3、or iBAQ),對鑒定到的蛋白質(zhì)進行定量,依照兩組內(nèi)iBAQ值之間的比值對特定蛋白的表達變化進行評定,總結(jié)纖維化肝臟組織中差異表達蛋白譜。應(yīng)用GO(Gene Ontology)功能分類分析和KEGG(Kyoto Enyoolpedia of Genes and Genomes)信號通路的富集分析方法對鑒定到的全蛋白表達譜進行差異表達分析。
　　結(jié)果:在對照組和實驗組中,我們分別鑒定到17382和20486條unique肽段,圖譜

4、平均利用率大于50％,共計鑒定到蛋白4991種(蛋白特異性肽段個數(shù)至少為1),其中差異表達蛋白有2135種(差異倍數(shù)大于或等于2),表達上調(diào)蛋白1264種,下調(diào)蛋白871中。
　　結(jié)論:纖維化肝臟組織中與細胞外基質(zhì)組成(Extracellular matrix organization)、細胞骨架組成(Cytoskeleton organization)、有機磷酸代謝(Organophosphate metabolic proce

5、ss)、細胞定位(Cellular localization)和細胞組分調(diào)節(jié)(Regulation of cellular component organization)相關(guān)蛋白的表達是上調(diào)的;另外,與小分子代謝(Small molecule metabolic process)、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(Protein transport)和有機氮化合物的代謝(Organonitrogen compound metabolic process),以

6、及四吡咯的合成過程(Tetrapyrrole biosynthetic process)有關(guān)蛋白的表達是下調(diào)的。信號通路富集分析結(jié)果表明,纖維化與 VEGF和T細胞受體信號調(diào)節(jié)通路密切相關(guān);四氯化碳誘導(dǎo)組中發(fā)現(xiàn)有20種屬于剪切體的蛋白表達是下調(diào)的,下調(diào)蛋白中與硫胺素代謝(Thiamine metabolism)、聚糖降解(Other glycan degradation)、SNARE相關(guān)囊泡運動(SNARE interactions i

7、nvesicular transport)、?；撬岷蛠喤；撬岽x(Taurine and hypotaurine metabolism)、初級膽酸合成(Primary bile acid biosynthesis)以及泛酸與 CoA的合成(Pantothenate and CoA biosynthesis)通路相關(guān)蛋白的富集度都高于18%,提示,纖維形成,可能與肝組織和神經(jīng)細胞代謝功能異常是密切相關(guān)的,另外,血管循環(huán)系統(tǒng)的功能異常有可能