中國南方主要地方山羊品種遺傳多樣性及進(jìn)化特征的研究.pdf

1、測定了飼養(yǎng)在中國的11個(gè)家養(yǎng)山羊品種(包括4個(gè)引進(jìn)品種)72個(gè)個(gè)體的線粒體DNA(mtDNA)控制區(qū)(D-環(huán))全序列，結(jié)果表明控制區(qū)全序列長度為1，212bp或1，213bp，共檢測到276個(gè)變異(突變)位點(diǎn)，占分析位點(diǎn)總數(shù)的22.56﹪，其中簡約信息位點(diǎn)175個(gè)，單一多態(tài)位點(diǎn)81個(gè)，所有這些突變均為兩核苷酸間的變異；同時(shí)，本次試驗(yàn)在中國本地山羊的序列中也檢測到T()C,G()A顛換的發(fā)生。顛換發(fā)生的頻率在0.0825﹪(簡陽大耳羊)～

2、0.66﹪(昭通山羊)之間，其中，馬頭山羊、榕江小香羊的核苷酸序列的顛換發(fā)生率均為0.413﹪，與作為外群參與分析的野生山羊(Capraaegagrus和Caprafalconeri)的顛換發(fā)生頻率(0.436﹪)相似。在堿基的l,075位有一個(gè)核苷酸的插入/缺失。 所有序列的TajimaD中性檢驗(yàn)結(jié)果不顯著(P＞0.10或0.05＜P＜0.10)，說明序列均為選擇性中性，同時(shí)也表明中國南方山羊品種在過去沒有出現(xiàn)群體擴(kuò)張。無論國

3、內(nèi)家養(yǎng)山羊，還是引進(jìn)品種均表現(xiàn)出了較高的核苷酸多樣度(Pi)和單倍型多樣性(H)。整個(gè)家山羊群體的平均核苷酸差異數(shù)為19.475，核苷酸多樣度為(1.608±0.09)﹪，這些差異共定義了60種單倍型，單倍型多樣性為0.977。其中，中國家養(yǎng)山羊7個(gè)品種有40種單倍型，引進(jìn)的4個(gè)品種有20種單倍型。中國南方山羊的單倍型多樣性(0.973)比引進(jìn)品種(0.903)高，但引進(jìn)品種的核苷酸多樣性(1.731﹪)、單倍型間的平均距離(0.018

4、7)、單倍型間的平均核苷酸差異數(shù)(19.475)高于中國南方山羊品種(分別為1.531﹪、0.0151和18.554)，但差異均不顯著(P＞0.05)。表明中國家養(yǎng)山羊的遺傳多樣性較為豐富，且品種間表現(xiàn)出弱的遺傳結(jié)構(gòu)。 將本研究測定的73條mtDNA的D環(huán)全序列與文獻(xiàn)報(bào)道的76條家山羊序列、2種野山羊(角猾羊和捻角山羊)的D環(huán)序列結(jié)合分析發(fā)現(xiàn)，文獻(xiàn)報(bào)道的單倍型僅有3種在中國南方地方山羊品種中存在。各家養(yǎng)山羊品種間平均核苷酸差異數(shù)

5、為19.475(7.50～30.42)，平均核苷酸差異率為1.607﹪(0.619﹪～2.512﹪)。品種間的Kimura雙參數(shù)距離變異較大(0.0008～0.0315)。許多品種都具有獨(dú)特的單倍型類型，只有2種單倍型在品種間有共享。各單倍型在品種間和品種內(nèi)的分布和頻率也不平衡，顯示出山羊mtDNA控制區(qū)(CR，D-loop)序列具有較為豐富的遺傳多樣性，尤其是在國內(nèi)地方山羊品種(系)中，D-loop序列的核苷酸單倍型之間沒有共享性，大