中國(guó)六個(gè)地方山羊品種微衛(wèi)星遺傳多樣性分析.pdf

1、該研究利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),分析了黎城大青羊、呂梁黑山羊、陽(yáng)城白山羊、新疆南疆山羊、新疆北疆山羊以及寧夏中衛(wèi)山羊6個(gè)地方山羊品種的分子水平上的遺傳多樣性,探討了各品種內(nèi)遺傳變異及群體間的遺傳關(guān)系,研究結(jié)果如下:1.篩選了19個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),均在6個(gè)品種得到了特異性擴(kuò)增結(jié)果,檢測(cè)到了177個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)達(dá)9.3個(gè),最少為6個(gè),可以較好地用于各品種內(nèi)及品種間遺傳多樣性分析.有效等位基因數(shù)目總共為76個(gè),有效等位基因數(shù)小于實(shí)際觀(guān)察等位基

2、因數(shù),這是各等位基因頻率分布不均勻的原因.2.哈代—溫伯格平衡檢驗(yàn)結(jié)果表明:6個(gè)群體基本處于遺傳不平衡狀態(tài),究其原因有隨機(jī)交配發(fā)生偏移、遺傳漂變以及選擇等.3.19個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均為中度和高度多態(tài)位點(diǎn),平均多態(tài)信息含量達(dá)0.6859~0.7083,6個(gè)品種具有豐富的遺傳多樣性.6個(gè)品種平均位點(diǎn)雜和度在0.3832-0.4277之間,雜和度較低,雖然有較高的多態(tài)信息含量,但還存在一定程度的近交,在以后的保種中應(yīng)防止退化.4.遺傳分化系數(shù)表明

3、:BM203、BM023、BMS6526、MAF65四個(gè)位點(diǎn)的G<,ST>估算值較大,分別為0.04755、0.0491、0.0107、0.0262,BM3033值最小,為0,這意味著前4個(gè)位點(diǎn)在不同品種間的基因分化占總?cè)弘s和度的4.755%、4.91%、1.07%、2.6%;其它位點(diǎn)G<,ST>值不高,這說(shuō)明遺傳變異主要存在于各個(gè)品種內(nèi),品種間遺傳變異不大.5.聚類(lèi)結(jié)果表明:6個(gè)山羊品種并不因?yàn)榈乩矸植级髯跃垡活?lèi),以Nei氏遺傳距離

4、為基礎(chǔ)的UPGMA法的聚類(lèi)結(jié)果與前人研究結(jié)果一致,呂梁黑山羊與陽(yáng)城白山羊具有較近的親緣關(guān)系,此外UPGMA和N-J圖中,黎城大青羊與新疆南疆山羊具有較近的親緣關(guān)系;以共祖距離為基礎(chǔ)的UPGMA和N-J聚類(lèi)結(jié)果,陽(yáng)城白山羊于新疆南疆山羊親緣關(guān)系較近,其它4個(gè)品種聚類(lèi)較為復(fù)雜些.但是從4個(gè)聚類(lèi)結(jié)果可以看出山西地方山羊與新疆山羊有可能存在一定的基因交流.6.將19個(gè)位點(diǎn)分為3、6、9、12、15五個(gè)梯度,統(tǒng)計(jì)4個(gè)品種兩兩之間的遺傳距離,5個(gè)梯