14144.植物非生物逆境下mirna分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及其在茶樹中的應(yīng)用

1、1分類號：單位代碼：10364密級：學(xué)號：S10090203498安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)位論文植物非生物逆境下植物非生物逆境下miRNA分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及據(jù)庫的構(gòu)建及其在茶樹中的應(yīng)用在茶樹中的應(yīng)用AliteraturecurateddatabasefmiRNAmolecularregulationinplantresponsetoabioticstressapplicationinteaplant(Camell

2、iasinensis)研究生：盛亮指導(dǎo)教師：韋朝領(lǐng)教授合作指導(dǎo)教師：申請學(xué)位門類級別：農(nóng)學(xué)碩士專業(yè)名稱：茶學(xué)研究方向：茶樹種質(zhì)資源與生物技術(shù)所在學(xué)院：茶與食品科技學(xué)院答辯委員會主席：二零一三年六月I摘要MicrNA(miRNA)作為一類非常重要的基因表達(dá)調(diào)控因子而日益受到關(guān)注。盡管有關(guān)miRNA在植物各種非生物逆境脅迫中的具體調(diào)控作用報(bào)道較多，但是目前還沒有關(guān)于miRNA與非生物逆境脅迫的調(diào)控關(guān)系的數(shù)據(jù)庫，導(dǎo)致人們難以從整體上分析miR

3、NA與多種非生物逆境間的復(fù)雜調(diào)控途徑與作用方式；同時(shí)有關(guān)miRNA參與茶樹對非生物逆境響應(yīng)機(jī)制的研究甚少。鑒于此，本研究利用文本挖掘方法構(gòu)建一個miRNA參與調(diào)控植物非生物逆境的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫，并對茶樹miRNA進(jìn)行預(yù)測分析，結(jié)合降解組測序?qū)⑴c茶樹非生物逆境的miRNA作用靶基因進(jìn)行功能驗(yàn)證。進(jìn)而初步揭示miRNA在茶樹遭受非生物逆境時(shí)的調(diào)控作用機(jī)制。本研究主要結(jié)果如下：（1）收集了有關(guān)miRNA在植物非生物逆境下調(diào)控作用研究的相關(guān)文

4、獻(xiàn)近200篇，分析了來自33個植物物種的682個miRNA與35個非生物逆境產(chǎn)生的1038個調(diào)控關(guān)系。利用文本挖掘的方法，構(gòu)建了植物非生物逆境下miRNA分子調(diào)控?cái)?shù)據(jù)庫PASmiR。該數(shù)據(jù)庫提供了數(shù)據(jù)的收集，標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)以及miRNA逆境關(guān)系的搜索等功能；可供檢索的信息包括：物種名稱、miRNA名稱、逆境名稱、miRNA的表達(dá)特征、試驗(yàn)方法、參考文獻(xiàn)和miRNA靶基因。用戶可能通過關(guān)鍵詞對數(shù)據(jù)庫搜索得到相關(guān)miRNA與逆境的關(guān)系。PASm

5、iR數(shù)據(jù)庫擁有2個免費(fèi)的連接網(wǎng)址：:hi.ustc.:8080PASmiR:pasmir.ahau.:8080PASmiR（2）基于PASmiR數(shù)據(jù)庫，對測序獲得的43個茶樹保守的miRNA家族與非生物逆境的關(guān)系進(jìn)行預(yù)測，結(jié)果表明，有31個保守miRNA家族與非生物逆境具有潛在的應(yīng)答關(guān)系，其中25個參與低溫脅迫，26個參與干旱脅迫。（3）利用降解組測序共鑒定出miRNA作用的靶基因203個，其中與低溫脅迫的靶基因189個，與干旱脅迫的靶