疾病相關(guān)的miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建及miRNA的預(yù)測(cè)方法.pdf

1、microRNA（miRNA，微小RNA）是近年來(lái)新發(fā)現(xiàn)的一類非編碼RNA，它在諸多重要生命過程中起著關(guān)鍵的調(diào)控作用，人們對(duì)其在疾病的診斷和治療等方面的應(yīng)用前景寄予厚望。microRNA的研究是涉及計(jì)算機(jī)技術(shù)、生物信息學(xué)、智能計(jì)算等領(lǐng)域的跨學(xué)科前沿方向之一，正引起學(xué)者們的廣泛關(guān)注。本文在分析了有關(guān)疾病相關(guān)的microRNA文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上，著重探討了microRNA與疾病的關(guān)系，完成了相關(guān)的特征數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)的開發(fā)及microRNA的預(yù)測(cè)方

2、法研究。主要完成的工作如下：
　　首先，由于研究microRNA與癌癥之間的關(guān)系需要大量的數(shù)據(jù)，而這些數(shù)據(jù)的類型不一、關(guān)系復(fù)雜，尤其是數(shù)據(jù)的冗余性、不一致性等問題、不利于后續(xù)的研究工作。因此，針對(duì)癌癥相關(guān)的microRNA生物數(shù)據(jù)，特別是對(duì)癌癥具有重要調(diào)控作用的microRNA進(jìn)行了研究。在分析有關(guān)microRNA與疾病文獻(xiàn)資料的基礎(chǔ)上，從已有的文獻(xiàn)中獲得并整理出已知疾病與microRNA關(guān)聯(lián)的信息，例如microRNA名字、基因

3、表現(xiàn)型、疾病類型、microRNA在疾病中的調(diào)控作用信息等。
　　然后，將整理完成后的數(shù)據(jù)按照一定的格式進(jìn)行規(guī)范化處理，使其必須包含microRNA與疾病的各自的信息以及二者之間存在的關(guān)系。為了便于對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲(chǔ)、瀏覽、查詢、提取和分析等，在Visual Studio.NET 2008平臺(tái)下建立了疾病相關(guān)的microRNA特征數(shù)據(jù)庫(kù)與查詢網(wǎng)站HMMD，并利用疾病相關(guān)的microRNA數(shù)據(jù)庫(kù)HMMD分析了microRNA對(duì)癌癥的