基于線粒體細(xì)胞色素b的7水系斑鱖遺傳多樣性分析.pdf

1、斑鱖(Siniperca scherzeri)是我國(guó)著名的經(jīng)濟(jì)淡水魚類之一,對(duì)生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定性也具有調(diào)節(jié)作用。隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)發(fā)展,過度捕撈和環(huán)境污染使野生斑鱖數(shù)量急劇降低;近些年斑鱖的養(yǎng)殖業(yè)迅速發(fā)展,易造成養(yǎng)殖斑鱖遺傳多樣性單一;人工增殖放流可能導(dǎo)致野生斑鱖的種質(zhì)受污染。因此,保護(hù)野生斑鱖資源刻不容緩。本文通過測(cè)定了中國(guó)7條水系10個(gè)地理群體176尾斑鱖的線粒體細(xì)胞色素b基因全序列,分析斑鱖遺傳多樣性、遺傳分化以及種群動(dòng)態(tài),旨在為野生斑鱖

2、的種質(zhì)資源管理和保護(hù)提供理論依據(jù)。主要結(jié)果如下:
　　1、176尾斑鱖線粒體細(xì)胞色素b基因1141bp,其中變異位點(diǎn)109個(gè),占全部核苷酸9.5％。4種堿基平均含量分別為A=24.54%,T=27.53%,C=32.53%,G=15.4%,出現(xiàn)反G偏倚。
　　2、在系統(tǒng)樹上,10個(gè)地理群體176尾斑鱖分為5個(gè)譜系,每個(gè)譜系具有一定地理分布范圍。譜系1由全部韓江上杭、多數(shù)閩江建甌、多數(shù)長(zhǎng)江池州和少數(shù)錢塘江千島湖個(gè)體組成;譜系2

3、由廣元群體組成;譜系3由南岳坡、桂平、英德的全部個(gè)體和池州少數(shù)個(gè)體組成;譜系4由丹東和淇縣群體構(gòu)成;譜系5由多數(shù)千島湖和少數(shù)建甌個(gè)體組成。
　　3、就7條水系而言,長(zhǎng)江存在3個(gè)譜系,錢塘江和閩江涉及2譜系,其他水系均只有1個(gè)譜系。5個(gè)譜系間的遺傳距離在0.009-0.061之間,分化系數(shù)Fst在0.93034-0.98082之間,譜系間分化較大。除了譜系2和3外,其他譜系間的差異達(dá)到亞種甚至是種的水平。譜系3內(nèi)長(zhǎng)江南岳坡和珠江桂平

4、間Fst為-0.00637,遺傳分化最小,基因交流不受限制;譜系4內(nèi)鴨綠江丹東和海河淇縣群體間Fst為0.15208、譜系1內(nèi)閩江建甌和韓江上杭群體間Fst為0.20324,均為中度分化,可進(jìn)行一定的基因交流。其他群體間均高度分化,基因交流受阻礙。長(zhǎng)江上、中、下游存在地理隔離,分化明顯。分子方差分析表明,把整體斑鱖分為7組,每組代表一條水系時(shí),水系間的變異程度為61.22%,水系內(nèi)群體間為28.27%,群體內(nèi)個(gè)體間的差異為10.51%;

5、;剔除掉少數(shù)池州、千島湖和建甌個(gè)體后,僅根據(jù)每個(gè)地理群體的主體譜系按水系分組的分子方差分析顯示,水系間變異為67.74%,水系內(nèi)群體間為29.84%,主體群體內(nèi)差異為2.42%;表明我國(guó)斑鱖的遺傳差異主要來(lái)自于水系間和群體間。
　　4、全部樣品總的單倍型多樣性(Hd)為0.928±0.008,核苷酸多樣性(Pi)為0.03288±0.00579。在10個(gè)地理群體主體譜系中,譜系5的千島湖(Hd為0.0858±0.063,Pi為0.

6、00237±0.00007)和譜系3桂平(Hd為0.914±0.079,Pi為0.00164±0.00065)的遺傳多樣性高,最低為譜系2廣元Hd和Pi為0。在176尾斑鱖中,檢測(cè)到34個(gè)單倍型,其中有5個(gè)是共享單倍型,其余是各個(gè)群體所特有。
　　5、核苷酸不配對(duì)分析和Tajima’s D和Fu’s中性檢測(cè)分析表明,譜系1的中性檢驗(yàn)為負(fù)值但P值不顯著,核苷酸不配對(duì)分析圖為雙峰;譜系2中性檢驗(yàn)為正值;譜系3、4、5的Fu’s都為負(fù)值