茄子種質(zhì)資源遺傳多樣性SSR和SRAP分析.pdf

1、茄子(SolanummelongenaL.)起源于亞洲南部熱帶地區(qū),古印度為其最早的馴化地,中國(guó)栽培茄子的歷史悠久,被認(rèn)為是第二起源地,擁有豐富的茄子種質(zhì)資源。進(jìn)行茄子種質(zhì)資源的遺傳多樣性研究,對(duì)茄子種質(zhì)資源的搜集、保存、鑒定、創(chuàng)新及育種工作都有重要意義。本試驗(yàn)對(duì)來(lái)自中國(guó)13個(gè)地區(qū)及印度、法國(guó)等35個(gè)國(guó)家的222份茄子種質(zhì)資源,利用SSR和SRAP兩種分子標(biāo)記方法進(jìn)行了遺傳多樣性分析。主要結(jié)果如下:
　　 1.采用正交試驗(yàn)設(shè)計(jì),

2、從Mg2+、Taq酶、dNTPs、引物及模板5種因素4個(gè)水平對(duì)SSR反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化,建立了適合于茄子的SSR-PCR優(yōu)化反應(yīng)體系,即10μL反應(yīng)體系組成為:10×Buffer1μL,25mmol/LMg2+1.5μL,2.5mmoL/LdNTPs0.8μL,10μmoL/L引物1.0μL,50ng/μL模板DNA1.5μL,5U/μLTaq酶0.1μL,無(wú)菌水3.2μL。
　　 2.從供試材料中選取形態(tài)學(xué)上差異較大的5份栽培茄

3、和3份野生茄材料用于引物篩選。從416對(duì)SSR引物中篩選出5對(duì)多態(tài)性高、條帶清晰的引物;從431對(duì)SRAP引物中篩選出25對(duì)重復(fù)性好的多態(tài)性引物。
　　 3.利用篩選出的5對(duì)SSR引物和25對(duì)SRAP引物對(duì)供試的222份茄子材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增,5對(duì)SSR引物共擴(kuò)增出23條清晰度高、重復(fù)性好的條帶,平均每對(duì)引物產(chǎn)生4.6條,具有多態(tài)性的條帶為22條,占總擴(kuò)增帶的96％。其中栽培茄產(chǎn)生的多態(tài)性條帶比例為65.2%。25對(duì)SRAP引物

4、共擴(kuò)增出239條清晰度高、重復(fù)性好的條帶,平均每對(duì)引物產(chǎn)生9.6條,多態(tài)性條帶比例為100%。其中栽培茄產(chǎn)生的多態(tài)性條帶比例為74.9%。
　　 4.應(yīng)用Structure軟件對(duì)擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析,將供試材料分為5個(gè)亞類群——S1、S2、S3、S4、S5,分別包括31、11、66、51和63份材料;類群的劃分與地理來(lái)源存在一定關(guān)系:S1類群材料大都來(lái)自尼日利亞等非洲西南部國(guó)家,S2類群材料大都來(lái)自多哥等非洲國(guó)家

5、,S3材料大都來(lái)自中國(guó)、印度等亞洲國(guó)家,S4類群材料來(lái)自土耳其等亞洲國(guó)家,S5類群材料大都來(lái)自亞洲的中國(guó)。類群的劃分未能體現(xiàn)與果形和果色的直接相關(guān)性,但存在一定的規(guī)律:淺綠和白色茄子材料主要分布在S1和S3類群,綠色茄子材料主要分布在S2類群,深色(黑和紫)茄子材料則主要分布在S3、S4和S5類群;扁圓形狀的茄子材料主要分布在S1和S2類群,長(zhǎng)筒、卵圓、長(zhǎng)卵和圓球性狀的茄子材料主要分布在S3、S4和S5類群。
　　 5.基于St