冷脅迫下東鄉(xiāng)野生稻表達(dá)譜測(cè)序分析.pdf

1、野生稻是重要的種質(zhì)資源，它含有豐富的抗性基因，其中也包括抗寒基因。將轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)運(yùn)用到野生稻抗寒性研究上，能更加準(zhǔn)確的研究水稻的抗寒機(jī)制，有利于培育出高抗寒的水稻。
　　 苗期抗寒性研究的材料是12個(gè)水稻雜交組合，方法是葉片的相對(duì)電導(dǎo)率和植株的成苗率;轉(zhuǎn)錄組的研究對(duì)象是93-11、東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻、越冬混合池，方法是信息學(xué)分析技術(shù)。主要的研究結(jié)果如下:
　　 1通過(guò)觀察12個(gè)水稻雜交組合（包括父母本）的苗期葉片的

2、相對(duì)電導(dǎo)率和植株的成苗率，來(lái)探討水稻苗期抗寒性的雜種優(yōu)勢(shì)。經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)，雜交組合的相對(duì)電導(dǎo)率的超親優(yōu)勢(shì)值為負(fù)數(shù)，中親優(yōu)勢(shì)值在-37.27％～+21.02％之間，成苗率的中親優(yōu)勢(shì)值在-30.80％～+7.20％之間，雜種優(yōu)勢(shì)表現(xiàn)為中親優(yōu)勢(shì)。并且可以看出粳稻在抗寒性上優(yōu)于秈稻。
　　 2四種水稻材料冷處理（4℃、3天）前后的表達(dá)譜的原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)格式轉(zhuǎn)換、去除雜質(zhì)序列后得到的數(shù)據(jù)量都大約有600萬(wàn)個(gè)reads。通過(guò)比較不同樣本間的數(shù)據(jù)

3、發(fā)現(xiàn)這四種水稻響應(yīng)冷處理均發(fā)生廣泛的基因表達(dá)調(diào)控變化，響應(yīng)冷刺激上調(diào)的基因數(shù)均顯著大于下調(diào)的基因數(shù)，93-11、東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻和越冬混合池上調(diào)的基因數(shù)依次為2691、2322、2372和1836，下調(diào)的基因數(shù)依次為1652、1503、1553和1501。
　　 通過(guò)將東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻以及越冬混合池分別與93-11進(jìn)行差異表達(dá)基因比較，它們下調(diào)基因依次相差了799個(gè)、894個(gè)和778個(gè)，上調(diào)基因依次相差了775個(gè)、9