甘藍(lán)型油菜千粒重主效QTLSWA7精細(xì)定位.pdf

1、本課題組前期借助分子標(biāo)記和QTL定位等生物學(xué)手段在9個環(huán)境下利用282個SG-DH(Sollux/Gaoyou)群體對甘藍(lán)型油菜的19條連鎖群進(jìn)行了千粒重QTL的初定位,其中在第7條連鎖群上發(fā)現(xiàn)了一個主效QTLSWA7,并且在7個環(huán)境中穩(wěn)定表達(dá),位于標(biāo)記EST12a到ZAAS864之間,遺傳距離為40.3cM,平均加性效應(yīng)為0.148g。隨后,劉玉霞在此基礎(chǔ)上對SWA7精細(xì)定位,利用BC3F2/BC3F3（基因型/表現(xiàn)型,下同）和BC4

2、F1/BC4F2世代群體將目標(biāo)區(qū)間鎖定在標(biāo)記sR0282R至ZAA864之間4.3cM的遺傳距離（劉玉霞,未發(fā)表）,兩親本間等位基因的差異達(dá)0.231g。前人的研究結(jié)果為后續(xù)SWA7精細(xì)定位和圖位克隆打下了良好的基礎(chǔ)。
　　 本研究在以上基礎(chǔ)進(jìn)行,通過對目標(biāo)區(qū)間標(biāo)記輔助選育,材料包含受體親本Gaoyou目標(biāo)基因組片段的近等替換系BC4F2、BC5F1、BC4F3、BC5F2和BC6F1共5個世代,借助白菜第7條連鎖群的基因組序列

3、信息發(fā)展位置特異性標(biāo)記。進(jìn)一步對QTL目標(biāo)區(qū)間進(jìn)行確認(rèn)和精細(xì)定位,主要研究結(jié)果如下:
　　 一、近等替換系的培育
　　 本研究根據(jù)前期構(gòu)建的近等替換系的基礎(chǔ)上,發(fā)展了BC4F3、BC5F2和BC6F1共3個世代的近等替換系,株系的選取原則為不同染色體分離片段重疊覆蓋目標(biāo)區(qū)間。
　　 二、SWA7目標(biāo)區(qū)間的確認(rèn)
　　 利用BC4F2/BC4F3、BC5F1/BC5F2這2個世代的單株的基因型和自交后代株系的

4、表現(xiàn)型對劉玉霞精細(xì)定位的SWA7QTL區(qū)間進(jìn)行確認(rèn)。通過單標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析和近等替換系之間的比對,發(fā)現(xiàn)標(biāo)記sR0282R至ZAA864之間確實(shí)存在一個主效QTL,在這個區(qū)間內(nèi),Sollux和Gaoyou等位基因間存在顯著差異(P＜0.001),均值差平均為0.217g。
　　 三、目標(biāo)區(qū)間分子標(biāo)記的加密
　　 將目標(biāo)QTL區(qū)間確認(rèn)在標(biāo)記sR0282R至S158-7后,借助白菜第7條連鎖群上基因組序列信息針對目標(biāo)區(qū)域發(fā)展位置

5、特異性標(biāo)記,在標(biāo)記RF36至S158-7增加了22個分子標(biāo)記。
　　 四、SWA7的精細(xì)定位
　　 利用BC4F3、BC5F2和BC6F13個世代單株基因型和相應(yīng)的自交后代表現(xiàn)型對SWA7進(jìn)行精細(xì)定位。通過單標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析以及近等替換系間的比對分析,將目標(biāo)區(qū)間預(yù)測至標(biāo)記N7-109至A07-2,物理距離為78kb。親本等位基因千粒重的均值差為0.230g。
　　 五、生物信息學(xué)分析
　　 對SWA778kb