甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子分子標記的開發(fā)及應(yīng)用.pdf

1、逆轉(zhuǎn)座子廣泛分布于植物界，是轉(zhuǎn)座元件中數(shù)量最多的一類。Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子是植物中研究較為深入的一類，其以RNA為中介，采用“復(fù)制-粘貼”的方式進行轉(zhuǎn)座，對植物基因組大小、結(jié)構(gòu)、進化等都有重要影響。逆轉(zhuǎn)座子在植物基因組中拷貝數(shù)多，異質(zhì)性高，并且在種內(nèi)和種間表現(xiàn)出較高的序列差異性和豐富的插入多樣性，基于這些特點開發(fā)的逆轉(zhuǎn)座子分子標記成為遺傳多樣性研究和遺傳連鎖圖譜及性狀定位的重要工具。
　　 黃瓜是我國主要蔬菜作物之一，也

2、是世界性重要蔬菜。多年的人工選育和及栽培的雜優(yōu)化，使黃瓜自然資源的多樣性受到侵蝕，栽培品種的遺傳背景變得更為狹窄。因此開展甜瓜屬逆轉(zhuǎn)座子分子標記的開發(fā)及其應(yīng)用研究，將對甜瓜屬作物的遺傳多樣性分析和抗病基因的發(fā)掘具有重要意義，并且為甜瓜屬的分子育種開拓了新的道路。
　　 1.甜瓜屬IRAP分子標記技術(shù)的建立根據(jù)甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子的長末端重復(fù)序列信息，通過逆轉(zhuǎn)座子引物設(shè)計及擴增體系優(yōu)化，建立起了適合于甜瓜屬的IRAP

3、(inter-retrotransposon amplifiedpolymorphism)標記系統(tǒng)。進一步將該標記用于甜瓜屬不同類型材料間的聚類分析，發(fā)現(xiàn)該標記能有效地檢測不同類型間的多態(tài)性，可成為構(gòu)建指紋圖譜新的標記系統(tǒng)。
　　 2.甜瓜屬REMAP分子標記的開發(fā)與應(yīng)用基于甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子的長末端重復(fù)序列信息，結(jié)合ISSR引物序列，在體系優(yōu)化的基礎(chǔ)上建立了適用于甜瓜屬物種的REMAP（Retrotranspo

4、son-microsatellite Amplified Polymorphism）標記系統(tǒng)。通過對46份甜瓜屬不同類型材料進行聚類分析，證明該標記系統(tǒng)能有效檢測甜瓜屬不同類型材料間的多態(tài)性，可以用于甜瓜屬作物品種鑒定及指紋圖譜構(gòu)建。
　　 3.基于逆轉(zhuǎn)座子分子標記和種間漸滲的甜瓜屬野生抗霜霉病相關(guān)基因的發(fā)掘利用逆轉(zhuǎn)座子分子標記cDNA-SSAP從酸黃瓜和抗霜霉病漸滲系ILDM10-4中得到霜霉病菌接種后差異表達基因片段58條。