應用SNP標記區(qū)分云南瑞麗野生枸櫞個體和柚SNP標記開發(fā)初探.pdf

1、柑橘有4000多年的悠久栽培歷史，而且種屬間較易雜交、芽變頻率較高，親緣關系復雜，致使人們難以對其進行分類研究，已有的幾個系統(tǒng)至今仍頗具爭議。DNA分子標記為研究柑橘分類和品種鑒別問題提供了新的手段。其中，單核苷酸多態(tài)性(SNP)在基因組中發(fā)生頻率較高、穩(wěn)定性好，可供人們進行規(guī)模化分析。對柑橘屬植物進行SNP分析，可以深入評價該屬植物的遺傳多態(tài)性，有助于理清柑橘種屬間的分類進化關系，有利于構建高密度遺傳圖譜、分析特定基因的功能以及進行分

2、子標記輔助育種等。本研究利用SNP標記分析了云南瑞麗野生枸櫞和柚的遺傳多樣性。結果如下：
　　 ⑴云南瑞麗野生枸櫞的遺傳多樣性研究。以地理分布上分屬3個地方居群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)的15個采自云南瑞麗的野生枸櫞個體為材料，利用PCR-SSCP技術篩選分析SNP標記，共從102對引物中篩選出了PCR產(chǎn)物多態(tài)性豐富的15對引物，并根據(jù)PCR產(chǎn)物譜帶多態(tài)性進行了遺傳多樣性分析。結果表明：1)這些野生枸櫞個體依據(jù)SNP多態(tài)性可分為3個大的類群

3、，Ⅱ5單獨為一類，Ⅱ1、Ⅱ2、Ⅱ6和Ⅲ1、Ⅲ2、Ⅲ5、Ⅲ6可聚為一類，其它樣品為另一類，分子標記結果與地理分布無明顯的相關性，表明地理隔離所造成的遺傳漂變尚不明顯，所有的個體應屬于同一繁育居群。2)只需憑借少數(shù)SNP組合就可以區(qū)分所有的個體，說明SNP標記在區(qū)分野生枸櫞個體上很有價值。
　　 ⑵柚種質資源的遺傳多樣性研究。用PCR-SSCP技術篩選了適合柚品種SNP多態(tài)性研究的引物。同時根據(jù)等位基因(單體型)來設計特異性PCR引