上海和內(nèi)蒙古地區(qū)輸血性傳播病毒的流行病學(xué)調(diào)查及ORF1基因的克隆表達.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、輸血型傳播病毒(Torque Teno virus,TTV)是由Nishizawa[1]于1997年在研究原因不明肝炎患者的過程中,用RDA(代表性差異技術(shù))方法從一名58歲的日本患者血液中分離到的一種病毒,是繼甲、乙、丙、丁、戊、己、庚之后的又一肝炎病毒--辛型肝炎病毒,從屬與指環(huán)病毒科(Anellovirida)。該病毒為單股環(huán)狀DNA,病毒基因組長度在2.1-3.9 KB之間,有兩個主要的開放閱讀框(ORF),ORF1可能編碼病毒

2、的主要結(jié)構(gòu)蛋白,ORF2主要編碼非結(jié)構(gòu)蛋白。TTV能感染人、非人靈長類、豬、犬、貓、牛、羊、駱駝等哺乳動物,對禽類的感染也有報道,但是,TTV的大小及特性在不同物種中差異較大,僅人的TTV就存在40多個基因型。TTV感染范圍較寬,傳播途徑較廣,與人類隱性肝病密切相關(guān),因此引起了世界各國學(xué)者的廣泛關(guān)注。
  本試驗根據(jù)GeneBank公開發(fā)表的SAa-10(AB060594)全序列設(shè)計型特異性引物,通過巢式PCR方法檢測來自上海某兒

3、童醫(yī)院的150份、年齡在1個月到8歲之間的兒童糞樣和109份成年人血樣,來自內(nèi)蒙的96份中老年人的糞樣,結(jié)果發(fā)現(xiàn):內(nèi)蒙96份中老年人糞樣中沒有陽性樣品,上海150份兒童糞樣中檢測到3份,上海109份血樣中有8份陽性,陽性樣品的序列與SAa-10序列以及不同陽性樣品序列間的同源性均在90%以上,說明TTV的感染不存在地域差異性,但是,感染率可能與年齡有一定的相關(guān)性。
  參照SAa-10(AB060594)對其中一份陽性樣品進行全序

4、列擴增,命名為L-SH(HM224451),通過Cluster比對及Mega4.0進行進化樹分析表明,本實驗分離株L-SH(HM224451)與日本株SAa-10(AB060594)的同源性達93.8%,進一步說明了同一基因型TTV之間不存在地域差異。對分離株L-SH ORF1中的蛋白,運用DNA-Star中Protean軟件進行抗原表位分析,選取抗原表位密集的區(qū)域設(shè)計引物進行擴增,并連接到表達載體PET-30中,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達。結(jié)

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