異源四倍體棉花分子遺傳圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)QTL定位.pdf

1、遺傳基礎(chǔ)狹窄已經(jīng)成為目前限制陸地棉遺傳改良的主要因素。在陸地棉和海島棉間進(jìn)行優(yōu)良基因的高效轉(zhuǎn)移滲透對(duì)二者的遺傳改良具有極為重要的現(xiàn)實(shí)意義，而限制這一過程的主要因素是連鎖累贅。分子遺傳圖譜無論在基因定位和輔助選擇以及重要基因的圖位克隆方面,還是在研究棉花的基因組組織結(jié)構(gòu)和起源進(jìn)化方面都具有重要的理論和應(yīng)用價(jià)值。本研究以海陸雜交群體為基礎(chǔ)，構(gòu)建了四倍體棉花的分子遺傳圖譜并對(duì)纖維品質(zhì)等性狀進(jìn)行了QTL 標(biāo)記定位研究。研究的主要結(jié)果如下：

2、>　　 1、從2701 對(duì)SSR 引物中篩選出753 對(duì)多態(tài)性引物，選取其中335 對(duì)引物對(duì)群體進(jìn)行分子檢測(cè)，獲得372個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)。本研究最終用于圖譜構(gòu)建的SSR 標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)為209個(gè)，其中包含121 對(duì)錨定引物。對(duì)209個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)的標(biāo)記基因型分析表明該群體分離正常，符合遺傳圖譜構(gòu)建要求。
　　 2、采用連鎖測(cè)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)LOD值為3.5，最大連鎖距離設(shè)為50cM，將209個(gè)多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn)定位到29個(gè)連鎖群上，標(biāo)記間平均遺傳距離為9

3、.6cM，連鎖圖譜覆蓋2010.7cM，約占棉花基因組的40.21％。所獲得的29個(gè)連鎖群可以定位到23條染色體和1條未知連鎖群上，分別為A1(chr.1)、D1(chr.15)、A2(chr.2)、D2(chr.4)、A3(chr.3)、D3(chr.7)、A4(chr.4)、D4(chr.22)、A5(chr.5)、D5(chr.19)、D6(chr.25)、A7(chr.7)、D7(chr.16)、A8(chr.8)、D8(chr

4、.24)、A9(chr.9)、A10(chr.10)、D10(chr.20)、A11(chr.11)、D11(chr.21)、A12(chr.12)、A13(chr.13)、D13(chr.18)和Unknown。
　　 3、對(duì)209個(gè)SSR 標(biāo)記位點(diǎn)進(jìn)行卡方檢驗(yàn)，其中有30個(gè)（14.30％）表現(xiàn)偏分離，全部定位到染色體或連鎖群上。偏分離標(biāo)記位點(diǎn)的分布在染色體或連鎖群以及A、D染色體亞組間很不均勻。分布在A染色體亞組（18.34

5、％）上的偏分離位點(diǎn)顯著多于D染色體亞組（10.20％）。在染色體9上發(fā)現(xiàn)明顯的偏分離標(biāo)記聚集現(xiàn)象。
　　 4、以新構(gòu)建的分子遺傳圖譜為基礎(chǔ)，利用BC1和BC1S1 群體表型數(shù)據(jù)，通過復(fù)合區(qū)間作圖法對(duì)四倍體棉花纖維品質(zhì)性狀進(jìn)行QTL 定位分析，檢測(cè)到13個(gè)與纖維品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL，分布于7條染色體上。纖維長(zhǎng)度相關(guān)QTL 4個(gè)、整齊度2個(gè)、伸長(zhǎng)率1個(gè)、馬克隆值3個(gè)、比強(qiáng)度3個(gè)，分別可以解釋表型變異的9.55％～19.36％、10.