草菇線粒體基因組的研究.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、本論文探討了草菇線粒體DNA的提取方法并對(duì)草菇線粒體基因組進(jìn)行了測(cè)序。在低溫下研磨破碎細(xì)胞，用差速離心法去除雜質(zhì)并沉淀線粒體，DnaseI酶解核DNA，經(jīng)過SDS和蛋白酶K裂解、酚/氯仿抽提可得到較高純度的線粒體DNA。
　　 草菇線粒體基因組測(cè)序共得到41個(gè)scaffolds，152個(gè)contigs，序列總長(zhǎng)度約為100kb。其中大于1kb的scaffolds和contigs分別為24和57個(gè)，其總長(zhǎng)度分別為46678bp和3

2、8193bp。
　　 經(jīng)過序列比對(duì)共得到14個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因，2個(gè)核糖體RNA基因rns和rnl；21個(gè)tRNA基因。
　　 對(duì)序列片段進(jìn)行了密碼子、堿基組成、酶切、重復(fù)序列分析，結(jié)果表明：草菇線粒體基因?qū)Φ谌粔A基為A或T的密碼子有較強(qiáng)的偏好性；2條scaffold片段共有14個(gè)單酶切位點(diǎn)；序列中堿基AT含量高于堿基GC；有6堿基重復(fù)序列1種，8堿基重復(fù)序列4種，9堿基重復(fù)序列1種，11和19堿基重復(fù)序列各2種，20、

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