遠(yuǎn)緣雜交中不育基因復(fù)雜上位性的分析方法研究.pdf

1、不育基因的位置及其效應(yīng)的估計(jì),是遠(yuǎn)緣雜交不育性機(jī)理研究中應(yīng)解決的重要問題之一。遠(yuǎn)緣雜交中很大部分雜種的不育性是由染色體上一系列基因控制的,不育基因間常常存在相互作用。本文建立了三種遺傳模型,對(duì)遠(yuǎn)緣雜交中不育基因的位置、效應(yīng)以及上位性效應(yīng)進(jìn)行估計(jì)。提出了模型參數(shù)估計(jì)的最大似然法和EM算法,用MonteCarlo模擬對(duì)模型的適用性、參數(shù)估計(jì)效果進(jìn)行了研究,并對(duì)水稻的一個(gè)種間雜交的回交群體和一個(gè)亞種間雜交的回交群體的分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行了分析。結(jié)

2、果如下:1、構(gòu)建了針對(duì)不同群體不育基因上位性效應(yīng)的三種遺傳模型,分別為F2位點(diǎn)-位點(diǎn)模型、BC位點(diǎn)-區(qū)間模型和BC區(qū)間-區(qū)間模型。推導(dǎo)出完全標(biāo)記信息下重組率和不育基因效應(yīng)估計(jì)的公式,建立了參數(shù)的假設(shè)檢驗(yàn)和多重檢驗(yàn)方法。
　　 2、MonteCarlo模擬研究結(jié)果表明,三種模型對(duì)不育基因的位置、效應(yīng)及上位性效應(yīng)均具有很好的估計(jì)作用。似然比值(LR)的三維立體圖顯示不育基因所處位置具有最大似然值,對(duì)不育基因的位置和效應(yīng)檢測(cè)效果好。<

3、br>　　 3、用Bootstrap估計(jì)參數(shù)偏差、標(biāo)準(zhǔn)差和均方差,并用其判斷群體樣本容量、連鎖程度和不育基因效應(yīng)對(duì)參數(shù)估計(jì)效果的影響。結(jié)果顯示,三種分析方法中的各參數(shù)在樣本容量大、連鎖緊密和不育基因存活效應(yīng)低的條件下估計(jì)效果最好。
　　 4、利用BC雙區(qū)間分析方法對(duì)水稻種間(Oryzasativa/Oryzalongistaminata//Oryzasativa)和亞種間(Balilla/NTH//Balilla)回交群體的標(biāo)

4、記基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行了研究。在亞種間檢測(cè)到第1、3、4、6、8、9、10、12號(hào)染色體上存在8個(gè)不育基因,分別為其命名為:Sa1、Sa3、Sa4、Sa6、Sa8、Sa9、Sa10、Sa12,具有上位性效應(yīng)的有11對(duì)。在種間檢測(cè)到第1、3、6、8、10、11染色體上存在7個(gè)不育基因,分別為其命名為:Sb1、Sb3、Sb6、Sb8、Sb10-1、Sb10-2、Sb11,具有上位性效應(yīng)的有5對(duì)。從種間和亞種間的5、11對(duì)基因的上位性效應(yīng)中發(fā)現(xiàn)上位