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文檔簡介
1、本文利用ISSR分子標記技術對分布于四川岷江流域的中國特有種-岷江百合(Lilium regale)的10個野生群體進行遺傳多樣性和遺傳分化研究,主要結(jié)論如下: (1)對165條引物進行篩選,篩出10條引物共檢測到180個位點,其中179個位點是多態(tài)位點,多態(tài)位點百分率(PPL)為99.44%。 (2)在物種水平上,觀察等位基因數(shù)(Na)為1.9944,有效等位基因數(shù)(Ne)為1.2916,Nei’s基因多樣度(h)為0
2、.2029,Shannon多樣性指數(shù)(I)為0.3398。 (3)在群體水平上,多態(tài)位點百分率(PPL)最高的是桃坪村群體(PPL=81.11%),最低的為光明鄉(xiāng)群體(PPL=63.56%);有效等位基因數(shù)(Ne)最高的為飛虹陰坡群體(Ne=1.3211),最低的是光明鄉(xiāng)群體(Ne=1.2011)t Nei’s基因多樣度(辦)最高的是飛虹陰坡群體(h=0.201 8),最低的是光明鄉(xiāng)群體(h=0.1397):Shannon多樣性
3、指數(shù)(I)最高的同樣也是飛虹陰坡群體(I=0.3180),最低的是光明鄉(xiāng)群體(I=0.2396)。 (4)經(jīng)POPGEN32計算得到遺傳分化系數(shù)(Gst=0.1894),AMOVA分子方差分析(PHIst=0.1934),基于Shannon多樣性指數(shù)分析得到的遺傳分化結(jié)果為((Hsp—Hpop)/Hsp=0.2038),都顯示出大部分的遺傳變異存在于群體之內(nèi)。基因流(Nm)為2.1398,說明岷江百合野生群體間存在著一定的基因流
4、。 (5)根據(jù)群體間的Nei’s(1978)無偏遺傳距離進行UPGMA聚類,10個群體可聚為三大類群:四川光明鄉(xiāng)群體為一類群;羊毛坪群體、飛虹陽坡群體、飛虹陰坡群體為一類群;石大關群體、桃坪村群體、色爾古群體、黃巖洞群體、薛城鎮(zhèn)群體和塔子山群體為一類群。 (6)岷江百合群體間的遺傳距離與地理距離的相關性系數(shù)r=0.0936,p>0.05,說明遺傳距離與地理距離的相關性沒有達到顯著水平。而Mantel Test結(jié)果(r=0
5、.5259,p<0.05)顯示,岷江百合群體間遺傳距離與海拔差距之間的相關性顯著。 (7)表型多樣性分析;根據(jù)馬氏距離用UPGMA法進行聚類分析,10個群體被聚為5大類群:光明鄉(xiāng)群體單獨聚為一類;飛虹陽坡群體也單獨聚為一類;桃坪村群體與塔子山群體聚為一類;飛虹陰坡群體、石大關群體、色爾古群體和薛城鎮(zhèn)群體聚為一類;羊毛坪群體和黃巖洞群體聚為一類。 (8)利用TFPGA的Mantel Test對馬氏距離與Nei’s無偏遺傳距
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