楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆.pdf

1、富含亮氨酸重復(fù)序列的類受體蛋白激酶(LRR-RLKs)參與植物生長(zhǎng)發(fā)育及對(duì)環(huán)境刺激應(yīng)答反應(yīng)的多種信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程,在植物生命活動(dòng)中發(fā)揮著重要功能。最新研究表明,LRR-RLKs在植物多種分生組織的形態(tài)建成及細(xì)胞分化過(guò)程中也承擔(dān)著關(guān)鍵的調(diào)控作用。
　　本論文使用生物信息學(xué)研究手段,通過(guò)與擬南芥的LRR-RLKs遺傳資源相整合,在木本模式植物毛果楊中分離PtLRR-RLK基因家族,挖掘與木本植物楊樹中與次生維管組織形態(tài)建成及形成層分化相關(guān)

2、的PtLRR-RLK基因,掌握其時(shí)空變化規(guī)律與表達(dá)調(diào)控機(jī)制。具體的方法是:在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,通過(guò)242個(gè)擬南芥基因在楊樹數(shù)據(jù)庫(kù)中blastp查找出384個(gè)楊樹LRR-RLK基因,通過(guò)分析這個(gè)基因家族的遺傳進(jìn)化樹特征,用不同表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)繪制表達(dá)圖譜,整個(gè)在形成層、發(fā)育木質(zhì)部、發(fā)育韌皮部等特異部位高表達(dá)的基因共115個(gè),并結(jié)合擬南芥中與發(fā)育功能相關(guān)的基因構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,預(yù)測(cè)楊樹基因的功能,并篩選出17個(gè)高表達(dá),且都在形成層和木質(zhì)部、韌皮部