蘋果CAX基因家族生物信息學分析及sMdCAX1基因遺傳轉化的研究.pdf

1、蘋果(Malus domestica Borkh.)是我國主要的經濟果樹之一，近年來隨著環(huán)境污染以及土壤重金屬化不斷加重，使得蘋果Ca2+流失增加，生理代謝紊亂，產量和品質不同程度的降低。鈣反向轉運體(Ca2+/H+ antiporters，CAXs)是一類重要的跨膜轉運蛋白，是調節(jié)胞內外Ca2+平衡重要的外向轉運體，在植物營養(yǎng)和離子轉運上起著非常關鍵的作用。目前很多CAXs基因已經被克隆，且在模式植物中得以轉化，但在木本植物中研究的很

2、少。為提高蘋果對Ca2+的吸收轉運以及提高抗逆性，本實驗在前人的研究基礎上，搜索蘋果全基因組，鑒定蘋果CAXs基因家族成員，并進行了生物信息學分析，然后從蘋果cDNA中克隆MdCAX1基因全長，構建了sMdCAX1基因的植物雙元表達載體，采用農桿菌介導的方法導入‘長富6號’中，獲得轉基因植物。主要研究結果如下:
　　1.利用生物信息學的方法對蘋果MdCAXs基因家族進行染色體定位、等電點、親疏水性、跨膜區(qū)域、亞細胞定位及保守結構域

3、進行了預測和分析，還分析了MdCAXs基因與其他物種CAXs基因的進化關系。用實時熒光定量RT-PCR法對蘋果MdCAXs基因在不同鹽處理下根、莖、葉中的表達變化進行分析。結果表明，蘋果MdCAXs家族包含8個成員，分別屬于CAXsⅠ型中的A亞型和B亞型，編碼的氨基酸在436～817個氨基酸之間，等電點在4.97～7.12之間，且都為疏水性蛋白;所有MdCAXs基因編碼的氨基酸都有11個及以上的跨膜區(qū)域，含有CAX基因5個典型的功能域:

4、N-端自抑制區(qū)域（NRR）、C-端功能區(qū)域、Ca2+功能域(CaD)、C功能域和D功能域。亞細胞定位預測發(fā)現MdCAXs主要是定位在質膜和內質網上。蘋果MdCAXs基因具有組織特異性表達特點，不同的鹽處理根、莖、葉中表達發(fā)生不同程度的變化，反映了MdCAX存在功能上的差異，對不同陽離子有特異性的應答反應。
　　2.根據NCBI登陸的MdCAX1基因序列設計引物，從蘋果葉片中克隆MdCAX1基因的ORF框，以克隆的ORF框為模版克隆

5、編碼去除N末端序列的sMdCAX1基因，獲得一段大小為1272 bp的片段。通過對MdCAX1基因ORF框酶切位點的分析，發(fā)現序列中在第413 bp和658 bp處有兩個SacⅠ位點，利用重疊PCR的方法以sMdCAX1基因為模版，將序列中的SacⅠ位點進行定點突變，獲得大小為1272 bp的突變序列sORF1+2Mu。同時構建pYH4215-sMd1植物雙元表達載體，將該表達載體導入農桿菌菌株EHA105中。
　　3.以‘長富6