基于單拷貝核基因(SCNGs)DNA序列的柑橘多樣性研究.pdf

1、柑橘是全球第一大水果，廣泛栽培在熱帶、亞熱帶及中間型氣候過(guò)渡地區(qū)。林奈(Linnaeus)1753年訂立柑橘屬，始創(chuàng)近代柑橘分類學(xué)。隨后，國(guó)內(nèi)外研究者從形態(tài)學(xué)到基因組學(xué)對(duì)柑橘分類問(wèn)題展開(kāi)了一系列研究，然而，柑橘屬及其近緣屬的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系仍存在爭(zhēng)議，柑橘屬植物的原始野生類型的種類和數(shù)目仍不確定，柑橘屬植物系統(tǒng)進(jìn)化基本框架仍需改良。由于柑橘芽變頻率高，種屬之間無(wú)生殖隔離，在條件合適時(shí)容易互相雜交且可育等原因，柑橘分類、進(jìn)化和雜種起源問(wèn)題較復(fù)

2、雜。
　　單拷貝核基因(SCNG)具有雙親遺傳、攜帶大量信息位點(diǎn)和直系同源等特點(diǎn)，較胞質(zhì)基因組能夠更好地反映物種間的進(jìn)化關(guān)系。本文以九里香屬(Murrayapaniculata(L.)Jack)，黃皮屬（Clausina）和蠔殼刺屬(Severiniabuxifolia(Poir.)Tenore)的3份材料作為外類群，選取了分別位于柑橘9條不同染色體上的9個(gè)SCNGs，對(duì)包括真正柑橘果樹(shù)類的27個(gè)生物型（其中以柑橘屬為主）進(jìn)行了單

3、拷貝核基因的克隆和序列分析，還選取了一個(gè)葉綠體matK基因作為對(duì)照。利用raxML和PAUP*(version4.0)軟件分別構(gòu)建了最大簡(jiǎn)約樹(shù)(MP)和最大似然樹(shù)(ML)。
　　1、SCNG序列及matK序列的ML和MP樹(shù)均表明，在本研究所選的材料中，立花橘比道縣野橘及南豐蜜橘更原始，印度野橘不屬于橘且與枸櫞親緣關(guān)系很近，莽山野柑（圓葉）是柑橘植物中非常原始的類型;宜昌橙聚在寬皮柑橘內(nèi)。
　　2、SCNG序列的ML和MP樹(shù)一

4、致表明，澳指檬屬與枸櫞親緣關(guān)系近，枳屬與金柑屬親緣關(guān)系較近。
　　3、葉綠體基因matK序列的ML和MP樹(shù)分析表明，枳屬與金柑屬各形成一支且枳屬位于樹(shù)的最基部;澳指檬屬不能獨(dú)立成支，且其母本與大翼橙和柚類關(guān)系密切。
　　最后我們結(jié)合SCNG和matK序列分析了柑橘屬植物部分雜交種的起源，酸橙是檸檬的一個(gè)母本，而檸檬父本是枸櫞;墨西哥萊檬母本是寬皮柑橘，父本為枸櫞;宜昌橙與寬皮柑橘具有較近的親緣關(guān)系;推測(cè)立花橘起源于我國(guó)南嶺山