中國部分黃牛mtDNA CytB基因部分序列遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文采用PCR產(chǎn)物,Sanger雙脫氧鏈終止法自動測序技術(shù),測定了我國黃牛13個(gè)品種82個(gè)個(gè)體的線粒體DNA細(xì)胞色素b部分(420 bp)序列,分析結(jié)果表明: 發(fā)現(xiàn)11個(gè)多態(tài)位點(diǎn),單一信息位點(diǎn)6個(gè),簡約信息位點(diǎn)5個(gè),確認(rèn)了13種單倍型,單倍型核苷酸平均差異數(shù)為2.331,核苷酸多樣度為0.555%,品種間核苷酸分歧度(Dxy)從0.048%~1.23%,雙參數(shù)距離從0.000~0.012;在10、17、78、81四個(gè)位置檢測到氨

2、基酸序列變異,黃牛各品種間在Cys、Leu、Ala、Ile、Thu、Val、Tyr七種氨基酸組成含量有差異。結(jié)果表明,中國黃牛遺傳多樣性較牦牛豐富。Cyt b基因核苷酸的變異類型在黃牛中為轉(zhuǎn)換和顛換,以轉(zhuǎn)換為主,沒有缺失/插入;核苷酸的替換發(fā)生在密碼子的第三位,以同義替換為主,黃牛各品種僅在安西黃牛中檢測到非同義替換,同義替換的速率(ds)高于非同義替換的速率(ka)。 黃牛的Cytb序列中,不同位點(diǎn)堿基含量不同,密碼子的第一位

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