DNA序列的對(duì)稱(chēng)性與真核基因調(diào)控元件模塊的分析.pdf

1、該文由兩大部分組成.一、DNA序列的對(duì)稱(chēng)性;1.比較DNA雙鏈編碼區(qū)及密碼子位置上堿基的分布頻率,比較氨基酸在雙鏈上的使用頻率,了解對(duì)稱(chēng)性情況,探討選擇壓力和自然突變?cè)贒NA雙鏈間是否平衡.2.比較三種形式的簡(jiǎn)并六寡核苷酸[AT]-[GC]、[AG]-[CT]、[AC]-[GT],在基因兩側(cè)的分布情況,探索是否存在對(duì)稱(chēng)性現(xiàn)象,是否可用于調(diào)控區(qū)預(yù)測(cè).二、真核基因調(diào)控元件模塊的分析;1.提取和選擇調(diào)控元件模塊的特點(diǎn),如序列相似性、寡核苷酸組

2、成、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、重復(fù)序列等方面的特點(diǎn).2.根據(jù)上述特征,對(duì)調(diào)控元件模塊進(jìn)行初步的識(shí)別.總體結(jié)論:1.細(xì)菌基因組中堿基分布的對(duì)稱(chēng)性,是DNA雙鏈上編碼區(qū)所承受的選擇壓力總體一致的結(jié)果.2.酵母基因兩側(cè)簡(jiǎn)并寡核苷酸分布的整體對(duì)稱(chēng)性,可能與其所受壓力大致平衡有關(guān).這一特性可用于基因調(diào)控區(qū)的預(yù)測(cè).3.以真核基因調(diào)控元件的模式識(shí)別為框架,建立并驗(yàn)證了CRMSS系統(tǒng)的正確性和數(shù)據(jù)管理的可靠性.4.通過(guò)HLA調(diào)控區(qū)的分析,發(fā)現(xiàn)了其調(diào)控序列的一些