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文檔簡介
1、苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)CCNWSX0020是從陜西風縣尾礦區(qū)生長的天藍苜蓿根瘤內(nèi)分離出來的一株菌,不僅具有多種重金屬抗性,還能促進天藍苜蓿在Cu污染土壤中生長。這種雙重特性使得該共生體系成為重金屬污染土壤修復(fù)的有效工具。本文通過RNA-Seq、基因敲除等技術(shù)分析了S.meliloti CCNWSX0020的Cu/Zn抗性機制,并對Cu/Zn抗性因子在根瘤菌-豆科植物共生體系及其生物修復(fù)Cu/Zn污
2、染土壤中的作用進行了研究。
通過轉(zhuǎn)錄組分析揭示了S.meliloti CCNWSX0020在四種脅迫條件下的基因表達模式。首先不考慮不同重金屬處理間的基因表達模式的差異,由短期的(30min)重金屬誘導(dǎo)表達的基因數(shù)目遠遠多于長期的(24h)重金屬處理,表明多數(shù)早期即時響應(yīng)的基因應(yīng)對重金屬脅迫時發(fā)揮了第一道防線作用,而少數(shù)長期表達的基因必然在S.meliloti CCNWSX0020重金屬抗性機制中發(fā)揮重要作用。在Cu或Zn長期
3、脅迫下,編碼P1B-typeATPase、多銅氧化酶、外膜蛋白和金屬結(jié)合蛋白的基因表達量顯著上調(diào),說明S.meliloti CCNWSX0020可能通過外排、氧化或隔離等機制來解毒。此外,通過分析不同的重金屬脅迫對基因表達模式的影響,發(fā)現(xiàn)Zn誘導(dǎo)下54%的表達上調(diào)的基因也受Cu共同誘導(dǎo),其主要集中在離子轉(zhuǎn)運、能量產(chǎn)生、氧化還原反應(yīng)、碳水化合物和氨基酸代謝等過程,說明S.meliloti CCNWSX0020通過多種途徑來防御非特異性的金
4、屬損傷,或調(diào)整整個細胞的代謝水平來適應(yīng)外界的環(huán)境脅迫。除了共同響應(yīng)Cu和Zn誘導(dǎo)的基因外,還有一些金屬特異性的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子、轉(zhuǎn)運蛋白、分子伴侶等被Cu或Zn誘導(dǎo)表達,說明S.meliloti CCNWSX0020對細胞內(nèi)Cu/Zn的穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)是復(fù)雜精細的,且對Cu/Zn的解毒或抗性機制有所不同。
P1B-type ATPases是細菌中非常重要的金屬離子外排系統(tǒng)。S.meliloti CCNWSX0020中存在五個P1B-typ
5、e ATPase,通過基因敲除和功能互補實驗證實其中CopA1b和ZntA兩個P1B-type ATPase與Zn/Cd/Pb抗性相關(guān)。根據(jù)序列同源性分析,CopA1b屬于P1B-1ATPases,而ZntA屬于P1B-2ATPases。S.meliloti CCNWSX0020中zntA基因的表達受Zn2+/Cd2+/Pb2+誘導(dǎo),且zntA基因缺失后造成細胞對Zn/Cd/Pb高度敏感,菌體內(nèi)大量Zn/Cd/Pb積累,說明S.meli
6、loti CCNWSX0020中的ZntA是一個典型的Zn2+-ATPase,參與細胞內(nèi)Zn2+/Cd2+/Pb2+的外排。而S meliloti CCNWSX0020中copA1b基因的表達受Cu+/Ag+誘導(dǎo),但copA1b基因缺失后不影響細胞的Cu耐受性,反而對高濃度的Zn/Cd/Pb敏感,造成菌體內(nèi)Zn/Cd/Pb積累,說明S.meliloti CCNWSX0020中的CopA1b雖然屬于P1B-1ATPases,但也可能參與細
7、胞內(nèi)的Zn2+/Cd2+/Pb2+的穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)。
通過基因缺失突變驗證了S.meliloti CCNWSX0020中六個Cu/Zn脅迫下表達顯著上調(diào)的基因與Cu/Zn抗性相關(guān)。金屬敏感性檢測顯示,△cueO對Cu專一敏感,其他幾個突變體則對Cu/Zn/Cd/Pb不同程度敏感,說明CueO發(fā)揮專一性地抗Cu作用,而其他幾個基因與S.meliloti CCNWSX0020的Cu/Zn/Cd/Pb耐受性有關(guān)。同時,選取S.melilo
8、ti CCNWSX0020野生型、Cu敏感突變體△cueO和三個Cu/Zn敏感突變體(△cusA-tike,△yedYZ,△fixH-like),來研究重金屬抗性因子對生物修復(fù)的作用。結(jié)果顯示,無論在有無重金屬脅迫條件下,△cusA-like突變菌株幾乎喪失了與天藍苜蓿共生的能力;cueO基因缺失嚴重抑制了Cu脅迫條件下△cueO突變菌株與天藍苜蓿的侵染和結(jié)瘤過程;在Cu和Zn脅迫條件下,yedYZ或xH-like基因缺失降低了△yed
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