如何找同源基因并用dnaman比對序列

1、Zakery2016年5月26日,如何在phytozome中找物種同源基因并用DNAman比對序列,首先到phytozome網站上選擇你要找的物種，比如水稻Oryza sativa v7_JGI (Rice),,點擊BLAST search,在target type中選擇proteome，把氨基酸序列復制到BLAST框中，點GO,,這是結果，得分越高說明同源性越高,點擊第一個前面字母G，得到如圖可以看到CDS sequence和Pep

2、tide equence,把基因名和CDS序列如圖復制到記事本，把txt格式改為SEQ格式（直接更改擴展名）,接下來就是用DNAman分析了,選擇輸入序列,,,,,,選擇序列文件所在位置,,,注意輸入的序列是DNA或者是蛋白質序列,打勾相應的選項,,然后一直點擊下一步,,選項不需要修改,默認就行,,選項不需要修改,默認就行,,選項不需要修改,默認就行,,,注意,由于是用了免費的版本,它會在這里加上了一段標記,手工去除它.,,序列前面一般