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1、1項目名稱:抗體抗體抗原分子識別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能抗原分子識別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能研究研究首席科學家:郭亞軍郭亞軍中國人民解放軍第二軍醫(yī)大學中國人民解放軍第二軍醫(yī)大學起止年限:20102010年1月20142014年8月依托部門:總后勤部衛(wèi)生部總后勤部衛(wèi)生部上海市科委上海市科委3主要研究內(nèi)容包括:主要研究內(nèi)容包括:1利用地理信息系統(tǒng)(利用地理信息系統(tǒng)(GISGIS)空間信息分析技術(shù)尋找抗體抗原表面結(jié)合位點識)空間信息分析技術(shù)尋找抗體抗原表面結(jié)
2、合位點識別規(guī)律別規(guī)律:在生物信息大規(guī)模抗體虛擬庫和抗體抗原分子識別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,統(tǒng)計抗體抗原結(jié)合界面兩側(cè)的空間信息特征和特征,建立基于空間特征的蛋白質(zhì)抗原空間表位預測方法,進行抗體抗原分子識別的分子動力學模擬,采用地理信息系統(tǒng)(GIS)的“空間信息分析與模型分析”功能發(fā)展空間比對技術(shù),尋找抗體抗原表面結(jié)合位點識別規(guī)律。2抗體抗原相互作用結(jié)構(gòu)學基礎(chǔ):抗體抗原相互作用結(jié)構(gòu)學基礎(chǔ):綜合運用結(jié)構(gòu)生物學、計算生物學、免疫學、分子生物學和生物化學的
3、方法,以具有重要生物學功能的抗原和抗體分子為研究目標,構(gòu)建抗原和抗體分子結(jié)構(gòu)測定平臺,抗原表位測定的技術(shù)平臺,以及抗體生物學功能機制的分析平臺。綜合運用X射線晶體學、溶液核磁共振、冷凍電鏡、X射線小角散射等多種結(jié)構(gòu)生物學手段測定抗體和抗原分子以及它們的復合物的在不同分辨率尺度上和不同測定方法基礎(chǔ)上的三維結(jié)構(gòu)信息,確定抗原分子上具有重要活性的功能表位,揭示抗體特異性高效識別靶標抗原的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),闡明抗體發(fā)揮其生物學功能的分子機理。3.3.抗
4、體抗原復合物的分子分布特征及功能識別基礎(chǔ):抗體抗原復合物的分子分布特征及功能識別基礎(chǔ):利用近場光學顯微術(shù)結(jié)合熒光量子點標記技術(shù)對單個抗原抗體在細胞表面的動態(tài)分布狀態(tài)進行可視化研究及數(shù)量化分析,結(jié)合單分子力譜測量技術(shù)和原子力顯微成像術(shù)對抗原抗體分子間結(jié)合,解離的動態(tài)過程給以精細探討。進一步闡明在生理條件下抗原抗體相互作用機制,修正已建立的數(shù)學理論模型。4基于計算生物學的抗體分子設(shè)計及功能進化規(guī)律研究基于計算生物學的抗體分子設(shè)計及功能進化規(guī)
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