柔性對接算法用于環(huán)糊精對客體分子的分子識別和手性識別的研究.pdf

1、中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)碩士學(xué)位論文柔性對接算法用于環(huán)糊精對客體分子的分子識別和手性識別的研究姓名：姚雪霞申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：應(yīng)用化學(xué)指導(dǎo)教師：潘忠孝蔡文生2003.5.1合；此外，B。環(huán)糊精對結(jié)構(gòu)相似的甾類化合物具有很好的分子識別能力。進一步分析顯示，甾類化合物的立體效應(yīng)、溶解性和環(huán)糊精空腔的尺徑大小可能是影響分子識別的主要因素。5將柔性對接算法運用于B一環(huán)糊精和單氨基取代p一環(huán)糊精與氨基酸衍生物以及苯的衍生物之間的手性識別研究。計算結(jié)果

2、表明：柔性對接算法所得到的經(jīng)驗結(jié)合自由能變化能夠用于識別D／L型氨基酸對映體和R／S型苯的衍生物對映體：對于帶負(fù)電荷手性客體分子，帶正電荷氨基酸取代B一環(huán)糊精比天然的B環(huán)糊精具有更好的手性識別作用。進一步分析各能量項表明：靜電相互作用，特別是其中的氫鍵對于旋光異構(gòu)體之間的識別起主要作用。通過以上研究，得出結(jié)論：(1)白行研制的柔性對接算法FDOCK是一種很有效的分子對接算法，結(jié)合所建立的理論模型，F(xiàn)DOCK可以用于環(huán)糊精和復(fù)雜客體分子之