天然無規(guī)蛋白識別的分子機制研究.pdf

1、天然無規(guī)蛋白是自然狀態(tài)下結構不規(guī)則的蛋白質，它們在細胞普遍存在，參與分子識別、化學修飾和分子伴侶等過程。無規(guī)蛋白的結構柔性使它們與靶分子的識別結合比規(guī)則蛋白具有明顯的優(yōu)勢。但是，目前關于無規(guī)蛋白的識別機制還不是很清楚，因此我們利用分子動力學模擬（MD）來研究無規(guī)蛋白p53和CBP的相互作用。腫瘤抑制因子p53的轉錄活化子域（TAD）和環(huán)磷酸腺苷響應元件結合蛋白（CBP）的細胞核受體共活化子域（NCBD）的結合可以調節(jié)細胞的轉錄和翻譯。N

2、MR實驗證明游離態(tài)NCBD和TAD都是天然無規(guī)的，它們經(jīng)過構象轉變形成了規(guī)則的復合物結構。NCBD和TAD在結合態(tài)和游離態(tài)的RMSD均值分析以及Kolmogorov-Smirnov假設檢驗說明局部TAD和NCBD的識別可能是誘導契合機制。量化分析的結果表明 NCBD和TAD整體結構的結合主要服從構象選擇機制。解折疊動力學和能量等高線圖分析進一步證明NCBD和TAD的識別是整體構象選擇和局部誘導契合機制。這些研究方法可用來分析其他無規(guī)蛋白