中國普通野生稻oryzarufipogongriff.的遺傳多樣性及其保護研究

1、中國農(nóng)業(yè)大學博士學位論文中國普通野生稻（Oryza rufipogon Griff.）的遺傳多樣性及其保護研究姓名：楊慶文申請學位級別：博士專業(yè)：作物遺傳育種指導(dǎo)教師：孫其信;賈繼增20040501A B S T R A C TC o n s e r v a t i o nb i o l o g yi s as c i e n t i f i c s u b j e c tw h i c hs t u d i e so nt h eb

2、a s i cb a c k g r o u n d sr e l a t e dt ob i o l o g i c a l d i v e r s i t y c o n s e r v a t i o n ．I t sk e yy i e l d i s a b o u tt h e c o n s e r v a t i o no fg e n e t i c d i v e r s i t yr e f e r r i n g

3、t h e t o t a l g e n e t i cv a r i a t i o ni n d i f f e r e n tp o p u l a t i o n so rd i f f e r e n t i n d i v i d u a l s w i t h i nt h es a m e p o p u l a t i o n ．T h e g e n e t i c v a r i a t i o n s m a

4、yi n c l u d e a l a r g e m o u n t o fs u p e r i o rg e n e s a n dd e t e r m i n et h ep o t e n t i a l i t yo f s p e c i e se v o l u t i o n ．T h i ss t u d ) , f o c u s e st h eg e n e t i cd i v e r s i t yo

5、f O r y z ar u f i p o g o nb o t hi m s i t ua n d e x - s i t uc o n s e r v e dp o p u l a t i o n sb a s e do n t h eS S R m o l e c u l a r m a r k e r sa n da l s oi n q u i r e st h ec o n s e r v a t i o ns t r a

6、 t e g i e sa n dm e t h o d s f o r0r u f i p o g o ni n C h i n a ．T h e t e x to f t h i s也e s i si Sd i v i d e d i n t of o l l o w i n g 4s e c t i o n s ．S e c t i o nI i s a b o u tt h ec o m p a r a t i v es t u

7、 d yo f t h eg e n e t i cd i v e r s i t i e sf r o mb o t hi n - s i t ua n de x - s i t uc o n s e r v e d g e n e p o o l s ．T w o p o p u l a t i o n s n a m e d A n j i a s h a n a n d S h u i t a o s h u p o p u l

8、 a t i o n s i nD o n g x i a n gC o u n t yw e r eu s e df o rt h i s p u r p o s e ．T h er e s u l t si n d i c a t e dt h a tt h ei n d i c e so fg e n ed i v e r s i t y ( H e 、o fi n - s i t u a n d e x - s i t u g

9、e n e p o o l s a r e 0 ．5 0 0 0 a n d 0 ．3 5 5 5 r e s p e c t i v e l y ．T h ed e n d r o g r a mo f t h et o t a ls a m p l e ss h o w e d t h a tt h ec l u s t e ro f e x - M t us a m p l e sW a S o n l yo n e o f t

10、h eb r a n c h e sw h i l ei n - s i t us a m p l e sc l u s t e r e di nw i d er a n g e s ．T h ei n d i c e so f b o t h 加《池a n de x - s i t us a m p l e s o f S h u i t a o s h u p o p u l a t i o n w e r e s i m i l

11、a r a n d t h e s a m p l e s c l u s t e r e d t a n g l y i n t h ed e n d r o g r a mw h i c hs e e m e dt h a t t h et w og e n ep o o l sw e r es i m i l a r ．H o w e v e ga b o u t4 0 ％o f t h es u c c e s s i v en

12、 u m b e r sf i ' o me x - s i t us a m p l e sw e r ec l u s t e r e dt o g e t h e rm e a n i n gt h a tt h es u c c e s s i v en u m b e rs a m p l e sm i g h tb ef r o mt h eS a l T l e c l o n e ．T h e r e f o r

13、 e ，t h e e x - s i t u s a m p l e sc o u l dn o tb er e p r e s e n t a t i v ef o rt h eg e n e t i cd i v e r s i t yo f t h eo r i g i n a lp o p u l a t i o n s ．T h es u g g e s t i o ni s t h a t i t i sn e c e s

14、 s a r y t o h a v e a n o t h e r c o l l e c t i o n o f g e n e t i c I E S 0 1 L r c e so f O ．r u f i p o g o n f o r e x - s i t u e o n s e r v u t i o n ．S e c t i o nI I ：T h eg e n o m l cD N A s a m p l e so f

15、5p o p u l a t i o n sW e l ' ea m p l i f i e dw i t h3 0p a i r so fS S Rp r i m e r s ．T h e n u m b e r s o f 5 ，1 0 ，1 5 ’’’。一e t c ．o f t h e t o t a l m a t e r i a l s w e r es a m p l e d r a n d o m l y e a

16、 c h t i m ea n dr e p e a t e d1 0t i m e s ，t h e nt h ea v e r a g en u m b e ro f a l l e l e sa n dt h er a t i ot o t h et o t a ln u m b e ro fa l l e l e sw e r ec a l c u l a t e d ．U s i n gt h es a m p l e dn

17、u m b e r sa n dt h er a t i o so f t o t a ln u m b e r o f a l l e l e sa sa x e st om a k e t h ed i a g r a m ．T h er e s u l t si n d i c a t e dt h a ti fw es a m p l et h en u m b e r b a s e do nt u r n i n gp o

18、i n t so f t h ed i a g r a m ，1 0 - 3 0i n d i v i d u a l sc o u l db er e p r e s e n t a t i v ef o rt h eg e n e t i cd i v e r s i t yo f t h et o t a lp o p u l a t i o n ．I f i ti sn e c e s s a r yt oh a v e t h

19、 er a t i oo f t o t a l a l l e l e sb e m o r e t h a n 9 0 ％a n d 9 5 ％，t h es a m p l e d n u m b e r s s h o u l db e1 5 - 2 5 o r3 0 - 4 0i n d i v i d u a l sr e s p e c t i v e l y ．T h i ss t u d ya l s oi n d i

20、 c a t e dt h a tt h ed i s t a n c eb e t w e e n t w os a m p l e ss h o u l db em o r e t h a n1 2m f o rl a r g ep o p u l a t i o n sa n d5 - 8m f o rs m a l l e r p o p u l a t i o n s ．S e c t i o n1 I I ：S e v e

21、np o p u l a t i o n s o f Or u f i p o g o ni n - s i t uc o n s e r v a t i o n s i t e sw e r e s e l e c t e d t os t u d y 也eg e n e t i cd i v e r s i t ya n dt h ec o n s e r v a t i o ns t r a t e g i e s ．T o t

22、a l 1 5 0a l l e l e sw e r ed e t e c t e dw i t h3 0S S Rp r h n e r s ·T h ea v e r a g en u m b e r o f a l l e l e so f e a c h l o c u sw a s5 ．4a n d t h ea v e r a g eg e n e d i ' r e r s i t y ( H s )w