中國松嫩草原短芒野大麥hordeumbrevisubulatumtrin.link人工種群的分子遺傳與表觀遺傳多樣性及其種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究

1、東北師范大學(xué)博士學(xué)位論文中國松嫩草原短芒野大麥（Hordeumbrevisubulatum（Trin.）Link）人工種群的分子遺傳與表觀遺傳多樣性及其種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究姓名：李毅丹申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：植物學(xué)指導(dǎo)教師：劉寶20070601A b s t r a c tG e n e t i co r e p i g e n e t i c d i v e r s i t y a n dp o p u l a t i o n g e

2、n e t i c o r e p i g e n e t i c s t r u c t u r e o f4a r t i f i c i a lp o p u l a t i o n s o f w i l d b a r l e y ( H o r d e u mb r e v i s u b u l a t u m ( T r i n ．) L i n k ) ，w h i c hc o m p r i s e do fa t

3、 o t a l o f 9 6 i n d i v i d u a l sc o l l e c t e df r o mt h eS o n g n e nP r a i r i ei nn o r t h e a s t e r nC h i n a w e r ea n a l y z e db ya m p l i f i e df r a g m e n tl e n g t hp o l y m o r p h i s m

4、 ( A F L P ) ，s p e c i f i c - s e q u e n c ea m p l i f i e dp o l y m o r p h i s m ( S S A P ) a n dm e t h y l a t i o n ·s e n s i t i v ea m p l i f i e dp o l y m o r p h i s m ( M S A P ) m a r k e r s ．T

5、h e e f f i c i e n c yo f t h e s e t h r e em a r k e r s w a s a l s oe v a l u a t e d ．W e r e p o r th e r et h a tb yu s i n g a m o d i f i e ds c o r i n gc r i t e r i o n ，M S A Pm a r k e rc a n b eu s e de f

6、 f e c t i v e l yt o d e t e c tp o l y m o r p h i s mi nD N A m e t h y l a t i o nw i t h i na n da m o n g p o p u l a t i o n so f ap e r e n n i a lw i l db a r l e y s p e c i e s ，H ．b r e v i s u b u l a t u m

7、．T h er e s o l v i n gp o w e ro fM S A P t o d e t e c tD N A m e t h y l a t i o n p o l y m o r p h i s mW a s f o u n d t ob ec o m p a r a b l et oA F L Pa n d S S A P , t o d e t e c tg e n e t i cp o l y m o r p

8、h i s mi nt h e 8 a l n e s e t o fp l a n t s ．s u g g e s t i n gt h a t M S A P 、j l ，i t h am o d i f i e ds c o r i n gc r i t e r i o nC a nb eu s e d e f f i c i e n t l yi nd e t e c t i n gD N A m e t h y l a t

9、i o np o l y m o r p h i s ma n da s s e s s i n g e p i g e n e t i cp o p u l a t i o n s t r u c t u r ei np l a n tp o p u l a t i o n s ．I tw a g d e t e r m i n e d t h a ta s a m p l e n u m b e ro f 1 2 W a s s u

10、 f f i c i e n tt or e p r e s e n t t h em a j o r i t yo fg e n e t i co re p i g e n e t i c ( i nt h ef o r mo fD N A m e t h y l a t i o n ) d i v e r s i t yf o r a g i v e np o p u l a t i o no fw i l d b a r l e

11、y ．I n d i c e so f ( e p i 一) g e n e t i c d i V e r s i t y ，( e p i - ) g e n e t i cd i s t a n c e ，g e n e f l o w , g e n o t y p ef r e q u e n c y , c l u s t e r a n a l y s i s ，P C A a n a l y s i sa n d A M

12、 O V A a n a l y s i sg e n e r a t e df r o mM S A P , A F L Pa n d S S A P m a r k e r sh a d t h es a m et r e n d ．O n t h e b a s i so f o u r r e s u l t s ，t h e r ee x i s t sa h J 【g h l e v e lo fc o r r e l a

13、t i o ni na r t i f i c i a lp o p u l a t i o n sb e t w e e n M S A P , S S A P a n d A F L P m a r k e r s b y M a n t e lt e s t( r > 0 ．8 ) ．T h i s i s i n c o n g r u e n t 麗t l l p r e v i o u s f i n d i n g

14、s s h o w i n g t h a t t h e r e i s v i r t u a l l y n oc o r r e l a t i o nb e t w e e nD N A m e t h y l a t i o np o l y m o r p h i s ma n dc l a s s i c a l g e n e t i cv a r i a t i o n s ，a n dt h u sf u r t

15、h e rc o r r o b o r a t e s t h e p o s s i b i l i t yt h a tt h e h i g h l e v e lo f g e n e t i c p o l y m o r p h i s mm a y b e a sa r e s u l to f e p i g e n e t i e r e g u l a t i o n ．W e a l s oc o m p a r

16、 e do u r r e s u l t s w i t ht h er e s u l t so fn a t u r a l p o p u l a t i o n s ．A n da l l r e s u l t si n d i c a t e d t h ep o p u l a t i o n d i v e r s i t y o f t h e a r t i f i c i a lp o p u l a t i o

17、 n sw a s l o w e r ．S o w g v e r ，u n l i k et h a td e t e c t e db yA F L P a n dS S A P , M S A P r e s u l t ss h o w e d t h a tm e t h y l a t i o np o l y m o r p h i s mo ft h ea r t i f i c i a lp o p u l a t

18、i o n s W a gn o t s i g n i f i c a n t l yr e d u c e d b u t s t a n di np a r a l l e ll e v e l ．T h i ss u g g e s t e dt h a tD N A m e t h y l a t i o np a R e m c h a n g e i n I - L b r e v 括u b u l a t u mp o

19、p u l a t i o n si sn o t o n l y r e l a t e dt oD N A s e q u e n c e v a r i a t i o n , b u t a l s ob e i n g r e g u l a t e d b y o t h e r c o n t r o l l i n g s y s t e m s ．K e y w o r d s ：M S A P , S S A P ，

20、A F L P ，m e t h y l a t i o n ，H o r d e u m b r e v i s u b u l a t u m ；p o p u l a t i o n( e p i - ) g e n e t i cd i v e r s i t y ；( e p i 一) g e n e t i c s t r u c t t t r e ；( e p i ·) g e n e t i c d i s