菰(zizanialatifoliagriseb.)中nbslrr類抗病基因同源序列的克隆及其在漸滲雜交系中的遺傳和表觀遺傳變異分析

1、東北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文菰(Zizania latifolia Griseb.)中NBS-LRR類抗病基因同源序列的克隆及其在漸滲雜交系中的遺傳和表觀遺傳變異分析姓名：陳郁申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：劉寶20040601A b s t r a c tM o r e t h a n 5 0 p l a n t d i s e a s e r e s i s t a n c e g e n e s h a v e b e e n

2、c l o n e da n ds e q u e n c e d i nt h ep a s tt e ny e a r s 。S e q u e n c ec o m p a r i s i o no fc l o n e dr e s i s t a n c e g e n e sf r o maw i d er a n g eo fp l a n tt a x ah a sr e v e a l e d s i g n i f

3、i c a n t s i m i l a r i t i e s i n s e q u e n c e h o m o l o g y a n ds t r u c t u r a l m o t i f s ．T h i s i s o b s e r v e d a m o n g g e n e s c o n f e r r i n gr e s i s t a n c e t o v i r a l ，b a c t e

4、r i a l ，a n d f u n g a l p a t h o g e n s ．P r o t e i n se n c o d e db yr e s i s t a n c eg e n e su s u a l l yc o n t a i nl e u c i n e ·r i c hr e p e a t s( L R R ) a n dn u c l e o t i d eb i n d i n gs

5、i t e ( N B S ) ．I nt h i s s t u d y ，ap a i ro fd e g e n e r a t i v e o l i g o n u l e o t i d e p r i m e r s d e s i g n e d f r o m c o n s e r v e ds e q u e n c e sf r o mc o d i n gr e g i o n so f t w od i s

6、e a s er e s i s t a n c eg e n e s ，N( t a b a c c o ) a n dR P S 2 似r a b i d o p s i s ) ，w e r eu s e dt o a m p l i f yr e l a t e ds e q u e n c e sf r o maw i l dr i c es p e c i e s ( Z i z a n i al a t i f o l i

7、 aG r i s e b ．) ．T h ep r o d u c t so fp o l y m e r a s ec h a i nr e a c t i o nf r o mZ ．1 a t i f o l i a g e n o m i cD N A u s i n g t h e s ep r i m e r sw e r ec l o n e di n t ot h ep G E M ．Tv e c t o r ，a n

8、de i g h td i s t i n c tR G A s ( r e s i s t a n c eg e n ea n a l o g s ) w e r eo b t a i n e d ．T h e e i g h t R G A s w e r e s e q u e n c e d a n d a n a l y s e d w i t hb i o i n f o r m a t i cS O f l w a r e

9、B i o e d i ta n dC l u s t a lX a n dt h e nc l a s s i f i e di n t o s e v e ng r o u p s ．B a s e do nt h e i r s t r u c t u r a l c h a r a c t e r i s t i c s ，t h ee i g h tR G A sw e r ed e d u c e dt o b e l o

10、n gt o t h e n o n ·T I R —N B S - L R Rs u b f a m i l y ．F u r t h e r m o r e ，b a s e do nt h en e a rc o m p l e t er i c eg e n o m es e q u e n c e i n f o r m a t i o n ，t h e e i g h t R G A s w e r e l o c

11、 a t e d i n f o u rd i f f e r e n tr i c ec h r o m o s o m e s ．S o u t h e m b l o ta n a l y s i sw a s p e r f o r m e dw i t he a c ho f t h ee i g h tR G A sa s p r o b e st o t h eg e n o m i cD N A o fzl a t i

12、f o l i a , t h e p a r e n tr i c e c u l t i v a r( M a t s u m a e ) a n d t h e i n t r o g r e s s i o nl i n e s ，w h o s eg e n o m i c D N A W a s d i g e s t e db y t h ee n z y m e s r a q I ，M s p Ia n d H p a