溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列遺傳變異及相關分析.pdf

1、本研究以與就巢性狀關系密切的 PRL 基因為候選基因，通過設計的7對引物對溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列進行克隆測序；運用PCR-SSCP手段分別對7對引物所得片段進行多態(tài)性分析；探尋 PRL 基因編碼區(qū)序列與產蛋量性狀的相關程度，并檢測基因突變位點。 PCR-SSCP分析結果表明，試驗群體PRL基因第1、2、3、5外顯子在所檢測位點上不存在SNP，所檢測到的等位基因在群體中已固定。在外顯子4中發(fā)現(xiàn)一處SNP位點G/A，分析結果表

2、明未引起氨基酸序列改變，為沉默突變。野生型等位基因(A)頻率為0.8837，突變型等位基因(B)頻率為0.1163；群體中檢測到兩種基因型，AA基因型頻率為0.7647，BB基因型頻率為0，AB基因型頻率為0.2326。在內含子2中發(fā)現(xiàn)的SNP位點為T/C突變，并得到了兩個基因型，其中C基因頻率為0.907，D的基因頻率為0.093；CC基因型頻率為0.814，CD基因型頻率為0.186，DD基因型頻率為 0。對試驗群體中這兩個SNF位

3、點分別進行卡方檢驗，結果表明其基因型分布與理論比例差異不顯著(P>0.05)，均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。經SPSS軟件對PRL基因SNP與溆浦白鵝產蛋量性狀的相關進行統(tǒng)計分析，結果表明不同基因型對產蛋量性狀影響不顯著(P<0.05)。 將溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列與其他禽類比較，其中溆浦白鵝與皖西白鵝、農安籽鵝、萊茵鵝和馬崗鵝等同源性分別為99.7％、99.7％、99.6％、98.8％；與北京鴨同源性為98.

4、4％；與家雞同源性為92.0％。 經氨基酸序列分析表明，溆浦白鵝與皖西白鵝、萊茵鵝分別在第69位的氨基酸(L/F)和第56位氨基酸(H/R)有變化，但親水性、極性以及電荷都沒有發(fā)生變化，只是分子量略有變化，此變化在第1個a螺旋位置；與馬崗鵝比較有三個氨基酸突變位點，首先在第6位氨基酸有個A/D的突變，其在信號肽序列上發(fā)生了氨基酸性質上的改變，其次，在第105位氨基酸有個D/H的突變，其突變位點在第4個a螺旋位置，其親水性、極性以

5、及電荷都沒有發(fā)生變化，只是分子量略有變化，再者，在第205位氨基酸有個R/H的突變。這些突變對于PRL保守的分泌和運輸方式可能是必須的，但是是否影響其功能還有待于進一步研究。 通過生物信息學分析結果顯示溆浦白鵝PRL基因內含子2突變位點T/C顛換可能導致此處增加了個SRY因子并可能導致TSt-1因子改變?yōu)镹kx-2因子。利用密碼子使用頻率庫對溆浦白鵝PRL基因外顯子4發(fā)生的G/A突變位點進行分析，發(fā)現(xiàn)密碼子CUG變?yōu)镃UA，兩者