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文檔簡介
1、計(jì)算機(jī)分子模擬研究可以從原子水平的分子模型來模擬分子的結(jié)構(gòu)、行為,進(jìn)而預(yù)測體系的各種物理、化學(xué)性質(zhì),因而可以對(duì)物質(zhì)材料給出在原子分子水平上的微觀圖像,為系統(tǒng)地研究和開發(fā)新型材料提供更多的理論依據(jù)。其重要性己得到了廣泛的認(rèn)識(shí)。 該文用Cerius2軟件在sgi3800工作站上對(duì)自組裝二十烷二羰基二-L-谷氨酸球形螺旋納米管的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究,主要內(nèi)容包括: 對(duì)球形螺旋納米管的結(jié)構(gòu)及二十烷二羰基二-L-谷氨酸分子(EDGA)的
2、特點(diǎn)進(jìn)行分析研究,根據(jù)EDGA分子在納米管壁中的受力情況,以一個(gè)EDGA分子為結(jié)構(gòu)單元,確定了相當(dāng)于二維周期邊界條件的三維周期邊界模型和EDGA單層膜聚集體模型。由分子動(dòng)力學(xué)構(gòu)象搜索法尋找到能量最低的分子構(gòu)象。并以能量最低構(gòu)象的EDGA分子搭建出不同尺寸大小的單分子膜聚集體,運(yùn)用分子力學(xué)、分子動(dòng)力學(xué)交替進(jìn)行的退火算法對(duì)EDGA單層膜聚集體進(jìn)行模擬,得到不同生長情況下EDGA單層膜聚集體的聚集狀態(tài),并最終得到了彎曲與扭轉(zhuǎn)兩種趨勢(shì)同時(shí)存在的
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