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文檔簡介
1、生物大分子在微尺度下的流動特性,是近年來生物大分子研究的熱點之一。DNA是典型的生物大分子。DNA的流動特性,即DNA在流場的不同條件下與時間有關(guān)的變形和流動規(guī)律,
從19世紀(jì)60年代開始,人們把經(jīng)典力學(xué)的方法和分子生物的實驗和統(tǒng)計分析技術(shù)相結(jié)合對DNA的桿狀螺旋結(jié)構(gòu)進行研究,取得了大量成果。近年來,隨著計算機水平的大幅提高,布朗動力學(xué)的計算機模擬作為一種數(shù)值研究手段在流變學(xué)領(lǐng)域得到廣泛的利用。對給定的模型可以很方便的設(shè)計
2、與之相應(yīng)的計算機模擬程序。
本文采用了帶有粘性的FENE模型來實現(xiàn)對DNA分子動力學(xué)的模擬,在模擬時運用了布朗動力學(xué)方法,所得到的主要結(jié)論如下:
(1)導(dǎo)出了帶有粘性的FENE模型的動力學(xué)方程和Euler迭代公式,運用Euler方法模擬了該模型在延展流中的動力學(xué),將教值模擬結(jié)果與Smith的實驗數(shù)據(jù)進行了比較,發(fā)現(xiàn)結(jié)果與實驗數(shù)據(jù)比較吻合。
(2)給出了強1階收斂的Milstein方法的迭代公式,
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