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文檔簡介
1、運用生物信息學等技術,首次成功地發(fā)現和克隆了魚類MIF基因以及SOCS基因家族的12個成員共55個基因,并進行了系統(tǒng)發(fā)育分析、分子起源研究以及基因的組織分布、差異表達和初步的功能鑒定。 第一篇建立了一套魚類免疫功能基因分析鑒定的生物信息學方法,包括數據庫利用、基因ORF和UTR預測、基因組序列錯誤糾正等,并例舉了詳細的實例,開發(fā)了GeneMaper/TransSeq等具有自主知識產權的生物信息學軟件,為深入開展魚類免疫基因的分子
2、克隆、生物學功能和分子進化等研究打下了方法學基礎。 第二篇進在黑青斑河豚(Tetraodon,nigroviridis)斑馬魚(Danio rerio)紅鰭東方魚屯(Fugu rubripes),底鯔(Fundulus heteroclims),,虹鱒(Oncorhynchus mykiss)鯰魚(Ictalurus punctams、),鮭魚(Salmo salar)和大唇樸麗魚(Haplochromischilotes)等多
3、種魚類中,系統(tǒng)開展了MIF基因的分子克隆與進化等研究,并分析MIF基因的拷貝數、組織分布和誘導表達規(guī)律,初步探討了其生物學功能。 第三篇首次從黑青斑河豚,斑馬魚,紅鰭東方鲀,三刺魚(Gasterosteusaculeatus)和青鳉(Oryzias latipes)等五種魚類中,系統(tǒng)分離鑒定了魚類SOCS基因家族12個成員共55個基因,其中SOCS3b,SOCS5b,SOCS8和SOCS9為SOCS家族新成員,迄今在包括哺乳動物
4、在內的所有物種中尚未見報道,極大豐富了SOCS家族研究的內容,為發(fā)現SOCS家族新功能奠定了基礎。對SOCS基因家族的分子起源與進化進行了系統(tǒng)研究,發(fā)現了SOCS基因家族在脊椎動物中的進化規(guī)律,首次發(fā)現SOCS家族可以分為Type Ⅰ SOCS(包括SOCS4-7、SOCS和SOCS9)和Type Ⅱ SOCS(CISH,SOCS1-3,SOCS3b和SOCS8)兩類,并提出了脊椎動物SOCS基因家族由兩個祖先分子通過內含子缺失、基因復
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