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文檔簡介

1、復旦大學碩士學位論文MHC與多肽綁定研究姓名：陳益青申請學位級別：碩士專業(yè)：計算機軟件與理論指導教師：周水庚20110512AbstractAbstractMHCmolecularplaysasignificantroleinimmunologybecausethebindingofMHCtopeptideistheprerequisiteforTcellimmunityInthefiledofbioin—formatics，manyr

2、esearchesfocusonthepredictionofpeptidebindingtoMHCTheresearchofpredictionofMHCbindingisnotonlyusefulinunderstandingtheprocessofimmunologybutalsoishelpfulforcomputer—aidedvaccinedesignMyresearchhasthreepurposeFirstly，deve

3、lopeanovelclassifierbasedonensemblelearningwhichhasbetterperformanceinpredictionSecondlymostmethodsofMHCbindingpredictionisonlyfromthepeptidesequenceinformationButinthenewmethodweshouldcombinepeptidesequenceandMHCstructu

4、reinformationsLastlydiversityofMHCmakesthewidelypredictionofMHCbindingverydifficult，especiallyMHCmolecularwhichhasfewpeptidebindinginformation；inthisresearchwetrytosolvethisproblemInresponsetothesethreepurpose，wedevelope

5、damethodcalledTEPI—TOPEpanandmanufactureaintegratedclassifierTEPITOPEpanwhichcombinessequenceandstructureinformationisamethodthatcouldbeusedindifferenceallelesAllMHCmoleculesthathavesequenceinformationcouldbecal—culateda

6、Positionspecificscoringmatrix(PSSM)forpredictionofbindingusingTEPITOPEpanIntegratedclassifierbasedonthethreemethodsthathavegoodperformanceisveryexcellentinpredictionofMHCbindingKeywords：MHCmolecular，Positionspecificscori

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