櫛孔扇貝與西施舌的群體遺傳學(xué)研究.pdf

1、為了更好地保護(hù)和合理利用我國(guó)的貝類資源，采用不同分子標(biāo)記對(duì)一些具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的貝類進(jìn)行群體遺傳分析很有必要，同時(shí)也是貝類遺傳育種研究中不可缺少的基礎(chǔ)性工作。 本論文主要包括三大部分： 1.櫛孔扇貝EST-SSR標(biāo)記的篩選和評(píng)價(jià)從3466條櫛孔扇貝EST序列中鑒定出169個(gè)微衛(wèi)星。選取30條櫛孔扇貝EST序列設(shè)計(jì)微衛(wèi)星引物，其中15對(duì)EST-SSR引物檢測(cè)出多態(tài)性。各位點(diǎn)的等位基因數(shù)為2-13個(gè)，每個(gè)位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)

2、為6.3個(gè)。期望雜合度為0.282-0.864，觀測(cè)雜合度為0.267-0.867。在海灣扇貝和蝦夷扇貝中進(jìn)一步檢測(cè)了這些位點(diǎn)的種間通用性。結(jié)果顯示新開(kāi)發(fā)的15個(gè)EST-SSR標(biāo)記具有較高的多態(tài)性和種間通用性，可以作為有價(jià)值的分子標(biāo)記工具在櫛孔扇貝及其它相關(guān)種中用于遺傳研究。 2.AFLP分子標(biāo)記的遺傳模式研究及其在野生與養(yǎng)殖櫛孔扇貝群體遺傳多樣性研究中的應(yīng)用。 AFLP分子標(biāo)記的遺傳模式在三個(gè)櫛孔扇貝全同胞家系中進(jìn)行了

3、檢驗(yàn)。多重檢驗(yàn)校正之前有9.3％的擴(kuò)增條帶不符合孟德?tīng)柗蛛x比，經(jīng)校正后有只有0.8％的擴(kuò)增條帶不符合孟德?tīng)柗蛛x比，此結(jié)果表明AFLP標(biāo)記可以認(rèn)為符合孟德?tīng)栠z傳模式。利用AFLP標(biāo)記分析櫛孔扇貝養(yǎng)殖群體間的遺傳多樣性水平并與野生群體進(jìn)行了比較。利用六對(duì)選擴(kuò)引物對(duì)四個(gè)養(yǎng)殖群體和兩個(gè)野生群體共139個(gè)個(gè)體進(jìn)行擴(kuò)增共產(chǎn)生293個(gè)位點(diǎn)。AFLP標(biāo)記在櫛孔扇貝養(yǎng)殖群體與野生群體中均具有高度多態(tài)性。期望雜合度的范圍為0.291(養(yǎng)殖群體)-0.295

4、(野生群體)，多態(tài)位點(diǎn)比率的范圍為92.1％(養(yǎng)殖群體)-93.9％(野生群體)。此結(jié)果表明雖然經(jīng)過(guò)30多年的人工養(yǎng)殖并未明顯降低櫛孔扇貝養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性。在櫛孔扇貝養(yǎng)殖群體間及養(yǎng)殖群體與野生群體間觀察到顯著的遺傳分化。本實(shí)驗(yàn)得到的遺傳信息為櫛孔扇貝的選育及合理管理方針的制定提供了理論依據(jù)。 3.西施舌野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析西施舌是我國(guó)沿海一種重要的經(jīng)濟(jì)雙殼貝類，其產(chǎn)量在過(guò)去十年間下降十分顯著。為了給保護(hù)政策和管理計(jì)

5、劃的制定提供數(shù)據(jù)參考，本論文采用5個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)山東即墨、膠南、日照，江蘇啟東和福建長(zhǎng)樂(lè)5個(gè)西施舌野生群體進(jìn)行了群體遺傳多樣性與遺傳分化的研究。結(jié)果表明，從等位基因數(shù)與雜合度上分析，遺傳多樣性較高(N=10-26，He=0.591-0.901)；等位基因頻率分布揭示出野生群體中存在一些稀有等位基因。通過(guò)對(duì)等位基因頻率比較分析，5個(gè)野生群體之間觀察到顯著差異的Fst值，其中長(zhǎng)樂(lè)群體與其它4個(gè)群體間的差異尤其顯著，群體間存在遺傳分化；長(zhǎng)樂(lè)群