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文檔簡介
1、豬嵴病毒(Porcine kobuvirus)是微小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)嵴病毒屬(Kobuvirus)成員。2008年,匈牙利學者首次報道在無臨床癥狀表現(xiàn)的豬糞便中發(fā)現(xiàn)豬嵴病毒;2009年,在中國豬群中也檢出了豬嵴病毒。自此之后,多個國家報道在豬群中檢測到豬嵴病毒,包括泰國、日本、韓國、荷蘭、巴西、西班牙、意大利、東非等。豬嵴病毒是一種具有傳染性、在世界范圍內廣泛分布的新型病毒,在腹瀉豬中有較高檢出率,認為可能
2、是豬腹瀉的病原,但鑒于其在沒有腹瀉的豬群中也普遍存在,且目前尚未能實現(xiàn)體外分離培養(yǎng),需要更多的研究來闡明其生物學特性及病原特性。
本研究旨在對四川地區(qū)豬嵴病毒病流行情況進行調查,并對四川株豬嵴病毒VP1基因分子流行病學特點進行分析;VP1蛋白是嵴病毒暴露在最外面的結構蛋白,是嵴病毒的優(yōu)勢免疫蛋白,本研究通過大腸桿菌表達系統(tǒng),表達豬嵴病毒VP1蛋白優(yōu)勢抗原表位區(qū),利用純化的重組蛋白建立一種檢測豬血清中豬嵴病毒抗體的間接ELISA
3、方法,為今后豬嵴病毒血清學診斷方法的研究奠定基礎。
本研究在2011-2012年從四川豬場中收集了163份豬糞便和腸道組織樣品,其中112份來自腹瀉豬,51份來自沒有腹瀉的豬。利用RT-PCR方法對樣品進行檢測,豬嵴病毒的總陽性率為53.4%(87/163),腹瀉樣品中豬嵴病毒總檢出率為64.3%(72/112),采集自無腹瀉豬的樣品中,豬嵴病毒的感染率為29.4%(15/51)。利用SPSS21.0軟件對腹瀉組數(shù)據(jù)和無腹瀉組
4、數(shù)據(jù)進行卡方檢驗,結果顯示豬嵴病毒感染和腹瀉具有極顯著相關性,x2=17.126,p=3.5×10-5;在哺乳仔豬、保育豬、育肥豬和成年母豬中,豬嵴病毒的感染率依次為:66.7%、39.1%、23.5%、40.0%,對四個年齡段感染數(shù)據(jù)進行卡方檢驗,分析顯示哺乳仔豬和豬嵴病毒感染具有極顯著相關性,x2=10.941,p=9.4×10-4。腹瀉豬和幼齡豬可能對豬嵴病毒更易感。
利用RT-PCR擴增豬嵴病毒VP1基因序列,通過分子
5、克隆,測序得到35個豬嵴病毒VP1基因序列(GenBank登錄號:KF157917-KF157951),核苷酸序列相似性為80.7%-100%,氮基酸序列相似性為87.2%-100%。利用MEGA5.0軟件對豬嵴病毒VP1基因序列進行系統(tǒng)進化分析,結果顯示本研究獲得的四川株豬嵴病毒分屬于四個大的分支,說明多株豬嵴病毒在四川地區(qū)流行,進化樹顯示豬嵴病毒VP1基因序列的分群無明顯地域性差異。通過序列分析,表明在兩只豬的糞便樣品中分別檢出3株
6、和2株豬嵴病毒共同感染,首次為多株豬嵴病毒共感染提供了依據(jù);通過重組分析軟件RDP和Simplot預測,發(fā)現(xiàn)3株共感染的豬嵴病毒A1、A2、A3之間存在重組事件,A2序列的VP1區(qū)段可能是由于A1和A3之間發(fā)生重組產生的。重組事件的發(fā)生會推動病毒基因組的進化,導致基因多樣性的發(fā)生。
本研究通過BepiPred、Bcepred、DNAStar中Protean來預測分析豬嵴病毒VP1蛋白線性抗原表位,綜合各種預測結果,選擇抗原表位
7、較集中、抗原指數(shù)較高的前半段(1-462bp)作為豬嵴病毒優(yōu)勢抗原表位區(qū),將選取的基因片段送公司進行密碼子優(yōu)化后合成基因,將合成的基因片段定向克隆至原核表達載體pET32a(+)中,構建重組表達質粒pET32-VP1,轉化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞中進行誘導表達,通過對誘導條件進行優(yōu)化,確定37℃,0.2mmol/L IPTG誘導表達4h為最佳誘導條件,重組蛋白大小為35.6KDa,以可溶性形式存在,在Western blo
8、t檢測中,通過Ni柱純化的VP1重組蛋白和豬嵴病毒陽性血清存在特異性反應,說明重組蛋白具有良好的抗原性。
利用純化的重組蛋白作為包被抗原,初步建立豬嵴病毒抗體檢測間接ELISA方法,并對間接ELISA反應的各個條件進行優(yōu)化,結果顯示,抗原的最佳包被濃度為2μg/mL,血清最適稀釋倍數(shù)為1∶200,37℃1h+4℃過夜為重組蛋白最適包被條件,5%脫脂奶粉封閉90min為最適封閉液和封閉時間,待檢血清溫育時間為60min,酶標二抗
9、工作濃度為1∶6000,作用時間為60min,TMB底物作用時間為15min,陰陽性臨界值為0.250。建立的間接ELISA檢測方法具有較好特異性,與豬傳染性胃腸炎病毒、豬流行性腹瀉病毒、豬輪狀病毒、豬瘟病毒、豬細小病毒、豬繁殖與呼吸綜合征病毒6種常見豬病病原陽性血清無交叉反應。建立的方法具有較好的重復性,批內重復性實驗和批間重復性實驗,變異系數(shù)均小于10%。用建立的間接ELISA方法,對170份豬血清樣本進行檢測,結果顯示65份血清為
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