豬圓環(huán)病毒2型和豬繁殖與呼吸綜合征病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及遺傳進(jìn)化分析.pdf

1、豬圓環(huán)病毒2型（Porcine circovirus type2, PCV2）是引起斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征、皮炎與腎病綜合征等相關(guān)疾病的重要病原體之一。豬繁殖與呼吸綜合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）能導(dǎo)致懷孕母豬流產(chǎn)、仔豬嚴(yán)重呼吸癥狀及死亡。因此，PCV2和PRRSV是影響?zhàn)B豬業(yè)發(fā)展的兩大病原體。目前，養(yǎng)豬場(chǎng)內(nèi)PCV2和PRRSV混合感染的

2、情況越來(lái)越普遍，臨床上混合感染豬只臨床癥狀包括嚴(yán)重的呼吸癥狀、流產(chǎn)和極度虛弱等，且常繼發(fā)嚴(yán)重的病毒性或細(xì)菌性疾病，導(dǎo)致嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。因此，PCV2和 PRRSV的混合感染的流行病學(xué)調(diào)查及兩種病毒的遺傳進(jìn)化分析對(duì)于綜合防控豬場(chǎng)疾病具有重要意義。
　　為了解PCV2和PRRSV在中國(guó)豬場(chǎng)的混合感染及流行情況，本實(shí)驗(yàn)自2013-2015年對(duì)吉林、遼寧、黑龍江、山西、山東、廣東6省進(jìn)行PCV2和PRRSV分子流行病學(xué)調(diào)查，采集了192份

3、樣品進(jìn)行檢測(cè)，PCV2陽(yáng)性率為64.3％，PRRSV陽(yáng)性率為23.4%，29份樣品為混合感染，陽(yáng)性率達(dá)18.5%。豬群中PCV2和PRRSV的感染比較普遍，混合感染率也較高，加重了疫病防控的難度。
　　采集自不同地區(qū)的12個(gè)陽(yáng)性樣品進(jìn)行PCV2全基因組擴(kuò)增測(cè)序及遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)，12個(gè)PCV2序列分別屬于PCV2b和PCV2d基因型。其中8個(gè)測(cè)序序列SX-Z1、SX-Z3、YQ、JL、SY-M-X3、SY-L-3、SY-L-X6和

4、SP-2單獨(dú)形成一個(gè)位于PCV2d-1和PCV2d-2之間的單系群，3個(gè)測(cè)序序列SY-Z-4、ZD-1和 ZD-7與只在丹麥流行的 PCV2c基因型毒株同源性高，分析發(fā)現(xiàn)是 PCV2c和PCV2b基因型間毒株的重組毒。PCV2毒株遷移進(jìn)化分析預(yù)測(cè)有PCV2毒株從丹麥遷移至中國(guó)。
　　采集自不同地區(qū)的12個(gè)PRRSV陽(yáng)性樣品中PRRSV ORF5、ORF7、部分Nsp2基因測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)，所有毒株均屬于美洲型；12個(gè)測(cè)序序列在GP5和

5、N蛋白的重要基序上均有關(guān)鍵氨基酸的突變；8個(gè)序列 SDdz-2013-1、SDta-2013-1、SDly-2013-1/2/3/4、SDly-2014-1和 SXkl-2014-1與HP-PRRSV一樣在Nsp2上的第481位和第533-561位氨基酸有30個(gè)氨基酸的不連續(xù)缺失；2個(gè)序列HLYyq-2015-1和LNsy-2014-2在Nsp2上出現(xiàn)新型缺失即第593-595位氨基酸缺失；1個(gè)序列SDly-2014-1與NADC-30