抗原肽與MHC分子相互作用QM-MM分子動(dòng)力學(xué)模擬研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、在MHCⅠ類(majorhistocompatibilitycomplexclassⅠ)分子抗原加工提呈過程中抗原蛋白在抗原提呈細(xì)胞(antigen-presentingcells，APC)的胞漿中被蛋白酶體(proteasome)裂解成短肽peptide，由轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)蛋白(transporterassociatedwithantigenprocessing，TAP)將蛋白酶體裂解產(chǎn)生的短肽片段從胞漿轉(zhuǎn)運(yùn)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔。短肽peptide在內(nèi)

2、質(zhì)網(wǎng)中與新生成的MHCclassⅠ類分子結(jié)合，形成peptide-MHC復(fù)合體被提呈到APC細(xì)胞表面，與T細(xì)胞表面抗原受體TCR特異性識(shí)別結(jié)合，使得CTL細(xì)胞開始活化、增殖、分化，進(jìn)而對(duì)腫瘤細(xì)胞進(jìn)行特異性殺傷。本文采用qm/mm多尺度生物大分子的分子動(dòng)力學(xué)模擬方法，以天然抗原肽TAX(LLFGYPVYVYU)與HLA-A*0201分子結(jié)合的晶體結(jié)構(gòu)為模板，替換抗原肽“錨點(diǎn)”氨基酸，將口袋氨基酸殘基的原子極化電荷在空間形成的靜電勢(shì)用電多極

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