笛鯛屬魚類長波段視蛋白(LWS)基因序列與進(jìn)化的比較分析.pdf

1、笛鯛屬(Lutjanus)魚類隸屬鱸形目(Perciformes)笛鯛科(Lutjanidae)，是廣泛分布于熱帶和亞熱帶的巖礁魚類，是我國南海海域重要的經(jīng)濟(jì)魚類。本文從分子系統(tǒng)進(jìn)化和基因序列分析兩個(gè)方面來闡述笛鯛屬魚類在進(jìn)化與序列結(jié)構(gòu)組成的關(guān)系，本研究選取線粒體片段(CO I)中性標(biāo)記和功能性核基因(LWS)進(jìn)行系統(tǒng)比較分析笛鯛魚類的進(jìn)化關(guān)系與物種形成，而且通過對(duì)LWS基因序列的分析對(duì)其結(jié)構(gòu)作進(jìn)一步的了解。
　　由于本文選取的對(duì)

2、象為14種笛鯛屬魚類，因此利用DNA條碼鑒定和篩選出的各物種典型標(biāo)本是有必要的。本文還選取了19種外群物種(其中包括脊椎動(dòng)物和無脊椎動(dòng)物)的LWS序列與本研究擴(kuò)增得到的14種笛鯛魚類的LWS基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析，其結(jié)果表明無脊椎動(dòng)物和陸生脊椎動(dòng)物各聚為一支且兩棲類介于陸生脊椎動(dòng)物和魚類之間。而笛鯛魚類一支與中性標(biāo)記相比顯示在奧氏笛鯛和畫眉笛鯛之間，四帶笛鯛和孟加拉笛鯛之間，及馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛之間的分子進(jìn)化關(guān)系較為近。從進(jìn)化

3、樹可以看到藍(lán)色笛鯛(四帶笛鯛和孟加拉笛鯛)和紅色笛鯛(馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛)分別聚在一起這與形態(tài)學(xué)分類系統(tǒng)中所側(cè)重的體色、體側(cè)帶型等外部形態(tài)特征有明顯的相關(guān)性。在高級(jí)階元上，氨基酸序列比對(duì)分析所得到的進(jìn)化關(guān)系與形態(tài)學(xué)分類是一致，即笛鯛屬、鯉形目(斑馬魚、金魚)和陸生脊椎動(dòng)物(人、鼠和蜥蜴)各自聚為一支。但在笛鯛屬的進(jìn)化支中聚類關(guān)系與中性標(biāo)記的系統(tǒng)進(jìn)化樹相比，畫眉笛鯛和奧氏笛鯛的發(fā)生了分離，在氨基酸180號(hào)位點(diǎn)中畫眉笛鯛是A而奧

4、氏則為S。這暗示著，在笛鯛屬魚類生態(tài)重疊區(qū)域(即地理隔離不完全)的物種分化過程中視蛋白LWS基因的選擇性進(jìn)化可能扮演了重要角色。
　　本研究測定了紅鰭笛鯛(Lutjanus erythopterus)和約氏笛鯛(Lutjanus johni)的cDNA的部分序列以及其3’UTR序列。其中紅鰭笛鯛包含可讀編碼框?yàn)?93 bp，編碼230個(gè)氨基酸，約氏笛笛鯛包含可讀編碼框690 bp，編碼229個(gè)氨基酸，而紅鰭笛鯛3’UTR為176