非同義突變對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的影響及其在人類(lèi)疾病中的意義.pdf

1、蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)執(zhí)行功能過(guò)程中起到重要的信息傳遞作用。非同義單核苷酸變異可能對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾產(chǎn)生影響。本研究對(duì)非同義突變數(shù)據(jù)及蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行了一系列特征提取、關(guān)聯(lián)分析；并結(jié)合突變與翻譯后修飾在不同疾病中的分布，進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能分析、網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及疾病標(biāo)志物探尋。首先，通過(guò)對(duì)八種常見(jiàn)且具有重要功能的蛋白質(zhì)翻譯后修飾類(lèi)型進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)類(lèi)泛素化位點(diǎn)保守性最強(qiáng)，磷酸化位點(diǎn)保守性最弱；對(duì)修飾位點(diǎn)附近序列具有選擇性的翻譯后修飾類(lèi)型，如磷

2、酸化、糖基化和羥基化，修飾位點(diǎn)附近不容易發(fā)生非同義突變；而不依賴(lài)修飾位點(diǎn)附近序列識(shí)別的翻譯后修飾，如乙酰化、類(lèi)泛素化和泛素化中，修飾位點(diǎn)附近更容易發(fā)生突變。只有部分突變能夠直接改變氨基酸的電性、疏水性等特征從而可能直接影響蛋白質(zhì)修飾功能。其次，我們重點(diǎn)對(duì)和受損修飾顯著相關(guān)的人類(lèi)遺傳病和癌癥進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)最顯著相關(guān)的遺傳病是“李法美尼癥候群”，最顯著相關(guān)的癌癥類(lèi)型是肺癌。最后，分別對(duì)兩種疾病進(jìn)行了修飾位點(diǎn)交互（Crosstalk）分析和受

3、損修飾蛋白互作分析，挖掘出了其中重要的功能模塊。肺癌中的受損修飾蛋白質(zhì)相互作用模塊包括了重要的分子標(biāo)記物如EGFR、MAP2K4、ABL1、STK33、KRAS、IGF1R；“李法美尼癥候群”中TP53蛋白質(zhì)上的受損修飾T_155（磷酸化），K_292（泛素化），K_292（乙?；┪稽c(diǎn)存在交互作用。本研究提出了受損修飾的概念并采用新的統(tǒng)計(jì)方法計(jì)算分析非同義突變對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的影響，采用網(wǎng)絡(luò)方式展現(xiàn)和分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間cros