mir-29家族對同一靶基因調(diào)控的熱力學(xué)性質(zhì)及其實(shí)驗(yàn)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、microRNAs是一類由19~23個(gè)核苷酸組成的小RNAs,其通過使靶mRNA降解或抑制靶mRNA翻譯的方式來調(diào)控基因表達(dá)。研究報(bào)道顯示microRNAs參與許多生物學(xué)過程,且microRNAs的發(fā)現(xiàn)對計(jì)算生物學(xué)和傳統(tǒng)生物學(xué)有很大影響。人類mir-29家族由mir-29a、mir-29b、mir-29c組成。研究表明,mir-29可調(diào)控人體細(xì)胞中參與細(xì)胞代謝、分化、凋亡、免疫等生物學(xué)過程相關(guān)的基因表達(dá),且在多種腫瘤和疾病中發(fā)現(xiàn)mir-

2、29的異常表達(dá)。mir-29家族成員具有相同的種子序列,有一些研究暗示它們可能對同一靶mRNA的調(diào)控程度并不相同。
   本文主要研究mir-29家族成員對同一靶基因調(diào)控的熱力學(xué)性質(zhì),并通過生物實(shí)驗(yàn)對理論計(jì)算結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。本文主要研究工作及結(jié)果如下:
   (1)本文通過三種預(yù)測軟件TargetScan、PicTar、miRanda預(yù)測mir-29家族的靶基因,并篩選出三種預(yù)測軟件共同的預(yù)測結(jié)果,從中挑選出與細(xì)胞周期及D

3、NA復(fù)制兩種生物學(xué)過程相關(guān)的4個(gè)靶基因,分別為REV3L、CDC42、CCND2、CDK6;
   (2)計(jì)算mir-29家族各成員分別與4個(gè)靶基因結(jié)合位點(diǎn)的自由能。自由能反應(yīng)熱力學(xué)性質(zhì)的穩(wěn)定性,數(shù)值越小說明miRNA-mRNA結(jié)合越穩(wěn)定,microRNA對mRNA的調(diào)控程度可能越強(qiáng)。隨后為驗(yàn)證理論設(shè)想是否正確,通過生物實(shí)驗(yàn)對這一假想進(jìn)行驗(yàn)證;
   (3)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)所得結(jié)果與理論設(shè)想一致,miRNA-mRNA結(jié)合雙鏈的

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