mir-29家族對(duì)同一靶基因調(diào)控的熱力學(xué)性質(zhì)及其實(shí)驗(yàn)研究.pdf

1、microRNAs是一類由19～23個(gè)核苷酸組成的小RNAs，其通過(guò)使靶mRNA降解或抑制靶mRNA翻譯的方式來(lái)調(diào)控基因表達(dá)。研究報(bào)道顯示microRNAs參與許多生物學(xué)過(guò)程，且microRNAs的發(fā)現(xiàn)對(duì)計(jì)算生物學(xué)和傳統(tǒng)生物學(xué)有很大影響。人類mir-29家族由mir-29a、mir-29b、mir-29c組成。研究表明，mir-29可調(diào)控人體細(xì)胞中參與細(xì)胞代謝、分化、凋亡、免疫等生物學(xué)過(guò)程相關(guān)的基因表達(dá)，且在多種腫瘤和疾病中發(fā)現(xiàn)mir-

2、29的異常表達(dá)。mir-29家族成員具有相同的種子序列，有一些研究暗示它們可能對(duì)同一靶mRNA的調(diào)控程度并不相同。
　　 本文主要研究mir-29家族成員對(duì)同一靶基因調(diào)控的熱力學(xué)性質(zhì)，并通過(guò)生物實(shí)驗(yàn)對(duì)理論計(jì)算結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。本文主要研究工作及結(jié)果如下：
　　 (1)本文通過(guò)三種預(yù)測(cè)軟件TargetScan、PicTar、miRanda預(yù)測(cè)mir-29家族的靶基因，并篩選出三種預(yù)測(cè)軟件共同的預(yù)測(cè)結(jié)果，從中挑選出與細(xì)胞周期及D

3、NA復(fù)制兩種生物學(xué)過(guò)程相關(guān)的4個(gè)靶基因，分別為REV3L、CDC42、CCND2、CDK6；
　　 (2)計(jì)算mir-29家族各成員分別與4個(gè)靶基因結(jié)合位點(diǎn)的自由能。自由能反應(yīng)熱力學(xué)性質(zhì)的穩(wěn)定性，數(shù)值越小說(shuō)明miRNA-mRNA結(jié)合越穩(wěn)定，microRNA對(duì)mRNA的調(diào)控程度可能越強(qiáng)。隨后為驗(yàn)證理論設(shè)想是否正確，通過(guò)生物實(shí)驗(yàn)對(duì)這一假想進(jìn)行驗(yàn)證；
　　 (3)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)所得結(jié)果與理論設(shè)想一致，miRNA-mRNA結(jié)合雙鏈的