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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
通過(guò)全外顯子組基因檢測(cè)對(duì)僅有全面強(qiáng)直陣攣發(fā)作的特發(fā)性全面性癲癇(IGTCS)患者進(jìn)行測(cè)序,從基因?qū)用嫣骄縄GTCS的致病基因及其發(fā)病機(jī)制,為IGTCS患者的個(gè)體化治療提供理論依據(jù)。
方法:
選擇2015年6月至2016年12月在西京醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科診斷為IGTCS的83個(gè)病例,對(duì)其進(jìn)行全外顯子組基因測(cè)序,將患者的測(cè)序結(jié)果與千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),參照人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)尋找突變位點(diǎn),利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)
2、突變位點(diǎn)對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響。
結(jié)果:
自2015年6月至2016年12月在西京醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科門(mén)診診斷為IGTCS并行全外顯子組基因檢測(cè)的患者共有83例,其中男性42例,女性41例,年齡為3~31歲,病史為1~23年。全外顯子組基因檢測(cè)結(jié)果顯示,83例患者中有70例患者結(jié)果為陽(yáng)性,13例結(jié)果為陰性,70例突變陽(yáng)性的患者中基因突變頻次由高到低前五位依次為CACNA1H(17例)、GPR98(16例)、SCN9A(12例)、
3、CASR(7例)、GRIN2A(5例)。
1.在IGTCS患者中存在CACNA1H基因c.844G>A、c.2243C>T、c.2318G>A位點(diǎn)的突變,這三個(gè)突變位點(diǎn)在既往的研究中已被證實(shí)與CAE相關(guān)。同時(shí)發(fā)現(xiàn)4個(gè)未見(jiàn)報(bào)道的突變位點(diǎn)即c.489G>C、c.568G>A、c.884G>A、c.4045G>A且其編碼的第163位Gln、第190位Gly、第295位Arg、第1349位Ala均在生物進(jìn)化過(guò)程中位于高度保守區(qū)域,利用
4、Polyphen程序預(yù)測(cè)均顯示可能對(duì)蛋白質(zhì)的功能造成影響;
2.在IGTCS患者中發(fā)現(xiàn)存在GPR98基因新的突變位點(diǎn)c.1797A>T,其編碼的第599位Arg在生物進(jìn)化過(guò)程中位于高度保守區(qū)域。PolyPhen程序預(yù)測(cè)其可能對(duì)蛋白質(zhì)的功能造成影響;
3.在IGTCS患者中,SCN9A基因c.2089C>T、c.2132T>C、c.2359T>C位點(diǎn)的突變未見(jiàn)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道且編碼的第697位Gln、第711位Leu、第7
5、87位Met均在生物進(jìn)化過(guò)程中位于高度保守區(qū)域。PolyPhen和SIFT程序預(yù)測(cè)其可能對(duì)蛋白質(zhì)的功能造成影響;
4.在IGTCS患者中,CASR基因c.1316C>G位點(diǎn)的突變?cè)诩韧墨I(xiàn)中未見(jiàn)報(bào)道,該位點(diǎn)編碼的第439位Pro在生物進(jìn)化過(guò)程中位于高度保守區(qū)域。利用PolyPhen程序預(yù)測(cè)其可能對(duì)蛋白質(zhì)功能造成影響;
5.在IGTCS患者中,GRIN2A基因c.2627T>C位點(diǎn)的突變未見(jiàn)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道且編碼的第876
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