全基因外顯子測序技術(shù)在肝細胞癌侵襲性研究中的應(yīng)用.pdf

1、目的：肝細胞癌（HCC）是一種常見的惡性腫瘤，全球范圍內(nèi)居惡性腫瘤死因第三位,HCC的發(fā)生與癌基因和（或）抑癌基因突變有關(guān)，但發(fā)病機制仍不明確，全基因組外顯子測序技術(shù)（Whole exome sequence, WES）是一種經(jīng)濟、高效的測序方法，可用于篩選鑒定復(fù)雜疾病的相關(guān)致病基因。本實驗擬采用WES技術(shù)對臨床上不同轉(zhuǎn)移潛能HCC組織及癌旁正常肝組織進行對比分析，初步探討肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的基因序列改變包括各種突變。
　　方法：將

2、10例HCC分按臨床特征分為高轉(zhuǎn)移潛能組和低轉(zhuǎn)移潛能組，分別提取HCC組織及周圍正常肝組織DNA，使用Complete Genomics（CG）Black Bird測序平臺進行測序，所得數(shù)據(jù)同參考序列對比篩選變異基因,首先進行兩組間對比后篩選出高潛能轉(zhuǎn)移組中特有的突變,其次篩選出僅在腫瘤組織中的突變。
　　結(jié)果：1.有58個突變僅在高轉(zhuǎn)移潛能組中出現(xiàn)；其中CCND3（rs1051130T/G）、CCRL2（rs3204849T/A

3、）、CNTN2（rs2229866C/T）、FAT2（rs10044879G/A、rs150946802A/T*、rs2278370G/A）、MAP3K19（rs1112542G/C,rs16831235C/T）、PARP15（rs12489170G/A）、RECK（rs36108087G/A*,rs16932912G/A）、SDC1（rs10205485T/A）曾被報道過同一些腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移有關(guān)；2.ADD1（rs4961G/T）、A

4、LDH2（rs112235942G/T*,rs671G/A,rs145077856G/C）及FTSJ3（rs2727288A/T）頻繁突變值得關(guān)注；3.有22個突變僅存在腫瘤組織中，其中ADGB（rs147022152A/T*、rs147045354G/T*）、CTNNB1（rs121913412A/G）、SAMD9L（rs92764797G/A*、rs92763885T/G*）曾被報道過同腫瘤發(fā)生有關(guān)。
　　結(jié)論：1．CCND3