從轉(zhuǎn)錄組和蛋白組水平研究大鼠再生肝的細胞增殖途徑和方式.pdf

1、本研究采用整合轉(zhuǎn)錄組和蛋白組的方法對大鼠肝再生(RatLiverRegeneration，RLR)的機理進行系統(tǒng)性分析?；蛭㈥嚵蟹治霭l(fā)現(xiàn)，3712個基因在大鼠肝再生中的表達差異顯著或極顯著，其中，2850個基因表達上調(diào)、816個基因表達下調(diào)和46個基因表達上/下調(diào)。蛋白質(zhì)分析發(fā)現(xiàn)，2168種蛋白的表達差異顯著或極顯著，其中，1518種蛋白表達上調(diào)、411種蛋白表達下調(diào)和239種蛋白表達上/下調(diào)。上述基因和蛋白統(tǒng)稱為RLR相關(guān)基因或RL

2、R相關(guān)蛋白。其中，2381個RLR基因為基因組特有，775種RLR蛋白為蛋白組特有，在mRNA或/和翻譯水平上與肝再生相關(guān)并相對應(yīng)的基因與蛋白，即RLR基因/蛋白2383種，其中，RLR基因1331個，RLR蛋白1393種。
　　在此基礎(chǔ)上，用已建立的數(shù)據(jù)庫和統(tǒng)計學(xué)方法，從細胞增殖的角度分析這些肝再生相關(guān)基因和蛋白表達變化在大鼠肝再生中預(yù)示的生物學(xué)意義。GeneOntology(GO)注釋發(fā)現(xiàn)，1009個RLR基因參與細胞增殖，5

3、06種RLR蛋白參與細胞增殖。對比上述基因和蛋白的表達變化發(fā)現(xiàn)，561個RLR基因未在蛋白組中查到,為基因組特有，89種RLR蛋白未在基因組中查到，為蛋白組特有，744種基因和蛋白相對應(yīng)并在mRNA或/和蛋白水平上與肝再生相關(guān)，稱為RLR基因/蛋白。同時，606個RLR基因參與細胞增殖信號通路，279種RLR蛋白參與細胞增殖信號通路。譜函數(shù)（Ep(t)值）分析表明肝臟細胞的增殖主要與FGF、PDGF、INS、OSM、IL2和HRH3信號

4、傳導(dǎo)活動密切相關(guān)。上述6條信號通路涉及特有基因9個，特有蛋白3種，基因/蛋白23種。同時，利用網(wǎng)絡(luò)原理和方法結(jié)合同類提取法分析發(fā)現(xiàn)，磷脂酶Cγ2(phospholipaseCgamma2，PLCG2)是上述6條細胞增殖信號通路的匯集點。PLCG2的表達受轉(zhuǎn)錄和翻譯水平的雙重調(diào)控，在大鼠肝再生中起重要作用。
　　綜上所述，本研究通過生物高通量檢測結(jié)合網(wǎng)絡(luò)原理和方法分析了大鼠肝再生中基因和蛋白表達變化預(yù)示的細胞增殖信號通路對細胞增殖活